треугольником, в бутылку или в коробку

У хорошей хозяйки на кухне царит порядок. Все стоит на своих местах, разложено по полочкам. Даже полиэтиленовые кульки из магазина, домашние умелицы умеют хранить так, что те занимают минимум места, не мнутся, находятся под рукой.

Как такое возможно? Достаточно изучить нехитрую науку, как сложить пакеты компактно в коробку, пустую пластиковую бутылку или хотя бы научиться сворачивать их в крохотные плотные треугольники, рулончики. Вариантов много. Рассмотрим самые простые и рациональные.

Как сложить пакет треугольником

Этим способом лучше складывать «майки». Размер значения не имеет.

Ход процедуры:

1. Из пакета вытряхивают крошки, мусоринки, чеки из магазина.

2. Раскладывают на столе.

3. Расправляют скомканные верхушки ручек.

4. Поддевают пальцами уголки боковых сторон в нижней части, ручки и выравнивают.

5. Повторяют манипуляцию с другой стороны.

6. Разглаживают руками по поверхности, выгоняя воздух.

7. Дважды складывают изделие пополам по длине. В итоге получается полоска, по ширине равная ширине ручек «майки».

8. Нижнюю часть заворачивают треугольником. Продолжают складывать, направляя движения вправо и влево, до середины длины ручек.

9. Оставшиеся свободными концы заправляют в образовавшийся кармашек.

Работа занимает максимум минуту, а в результате имеем маленький, плотный, не разворачивающийся треугольник. Хранят сложенные таким образом полиэтиленовые кульки в подходящей для этого емкости — ящике, коробке, полотняном мешке и т. д.

Смотрите как сложить пакеты компактно на видео:

Еще проще сделать из пакетика с ручками трубочку. Изделие складывают лентой, затем берут в руку и наматывают на два пальца, начиная с дна. Не доходя 8−10см до верха, продевают пальцы другой руки в ручки и поворотным движением делают петлю вокруг свернутого рулоном пакета. В итоге получается миниатюрный плоский прямоугольник.

Накопитель из пластиковой бутылки

В супермаркетах бесплатные маленькие кулечки выставлены в рулонах. Покупателям удобно отматывать и отрывать столько пакетиков, сколько нужно. Так почему бы не перенести этот способ хранения к себе на кухню? Тем более, что ничего сложного делать и покупать специальные органайзеры не придется.

Накопителем послужит пластиковая баклажка из-под минеральной воды, сладкой газировки, пива. Объем тары — 2 л. Можно использовать бутылку 0,5−1 л, но обычно маленьких кулечков в доме накапливается так много, что целесообразнее складывать именно в 2-литровую баклагу.

Алгоритм действий:

1. Пластиковую бутылку моют, высушивают.

2. Ножницами аккуратно срезают верхнюю часть. Разрез делают на 10−12 см ниже горлышка.

3. Срез затирают слегка мелкозернистой наждачной бумагой, чтобы в процессе эксплуатации не порезаться случайно.

4. Пакеты разравнивают и сворачивают в узкую ленту, как при складывании треугольником. Подготавливают таким образом все кульки, подлежащие компактной упаковке в бутылке.

5. Включите фантазию, и никто не догадается, что это всего лишь старая бутылка с пакетами

   Отворачивают ручки в сторону, «тело» скручивают рулоном.

6. Дойдя до середины берут следующий пакет, аккуратно кладут сверху и продолжают делать «ролл». Ручки «майки» отворачивать в сторону уже не нужно.

7. Так, лента за лентой сворачивают все пакеты.

8. Получившийся рулон вставляют в пластиковую бутылку.

9. Накрывают импровизированный накопитель отрезанной ранее верхней частью баклаги с завинчивающейся крышкой.

10. Ручки первой «маечки» вытягивают вверх так, чтобы они показались над горлышком бутылки.

Накопитель готов. Теперь, чтобы достать кулечек, достаточно потянуть ручки вверх. Пакет легко выходит из бутылки и тянет за собой следующий. Такой органайзер-дозатор удобен в использовании, занимает совсем немного места.

Можно поставить на полку, рабочую поверхность кухонного модуля, прикрепить двусторонним скотчем к внутренней стороне дверцы тумбы под мойкой.

«Пакетница» из картонной коробки

Используйте любые коробки — из-под салфеток, из-под чипсов…

Не менее рациональным способом хранения пакетов с ручками является упаковка в пустую картонную коробку.

Проще использовать в этих целях емкость из-под салфеток, на крышке которой имеется специальное отверстие.

Если же таковой в доме не окажется, можно взять любую коробку и самостоятельно прорезать ножом или ножницами щель длиной 15 см и шириной 2 см.

Складывать в такой накопитель пакеты очень просто:

1. Коробку накрывают крышкой с прорезанным посередине отверстием.

2. Пакет выравнивают руками на весу.

3. Укладывают внутрь емкости, оставив снаружи ручки.

4. Берут следующий кулек, выравнивают.

5. Нижнюю часть продевают сквозь ручки предыдущего и просовывают внутрь коробки, оставляя верхнюю часть снаружи.

6. В таком же порядке укладывают остальные пакетики, заполняя коробку.

Ручки последнего уложенного кулька выглядывают из накопителя. Теперь, чтобы достать пакет, достаточно потянуть за них. Когда один кулек будет извлечен, он автоматически потянет за собой следующий.

Вы удивитесь, как много места освободится, когда все пакеты будут расфасованы по размерам и уложены компактно в накопители. Просто и чрезвычайно удобно!

Смотрите еще несколько идей по хранению.

Как сложить пакеты компактно

Многие из нас предпочитают не выбрасывать, а хранить пакеты. Они могут использоваться в повседневном быту для последующих покупок, заворачивания каких-либо вещей или в качестве мусорных мешков. Однако традиционный метод хранения пакетов в пакете выглядит неаккуратно и усложняет поиск нужного предмета. Кроме того, изделия остаются мятыми и неопрятными.

В этой статье мы рассмотрим, как сложить пакеты компактно. Узнаем, как правильно складывать целлофановые фасовочные, бумажные и пластиковые пакеты, изделия с ручкой и без. Выясним, где можно хранить одноразовые майки и другие подобные изделия.

Как правильно складывать пакеты треугольником и трубочкой

Для аккуратного и удобного хранения пакетов дома изделия сворачивают в плотную трубочку, рулон, кульки, полоски или складывают треугольником и убирают в определенное место. Перед тем, как складывать пакеты в коробку, ящик или другое место, обязательно проверьте изделие на целостность, уберите мусор и крошки. При необходимости промойте емкость в воде и высушите.

Жирные пакеты, изделия после мяса и рыбы, емкости с неприятным запахом выкидывайте! Храните только отсортированные чистые и сухие предметы. Иначе внутри могут появиться вредные бактерии и микробы, плесень и грибок! Что делать, если в квартире завелись плесень и грибок, читайте здесь.

Жесткие и большие изделия из пластика, полиэтилена или другого материала просто складывайте пополам, кладите плотно друг к другу и убирайте в ящик или коробку. Тканевые сумочки и пакеты сворачивайте в трубочку, перевязывайте ручками и тоже убирайте в коробку, на дно шкафчика или в ящик.

Как сложить треугольником или трубочкой

Укладывание пакетика треугольником, кульком и в рулон — практичные и удобные способы складывания изделий из полиэтилена. Такие методы уменьшат объем предмета и не требуют много места для хранения. При этом объекты легко доставать. Предлагаем следующую методику, которая расскажет, как компактно складывать пакеты треугольником:

• Чтобы аккуратно сложить пакеты, разложите изделие на твердой поверхности и и разгладьте материал руками, уберите складки и выпустите воздух;
• Сложите пополам вдоль длины два раза;
• Осторожно загните угол полоски внизу, где нет ручек;
• Складывайте треугольник, сворачивая то влево, то вправо, пока не дойдете до участка с ручками;
• Ручки сложите вдвое и заверните внутрь полученного треугольника.

Небольшие целлофановые майки можно свернуть в трубочку. Разложите и разгладьте изделие, уберите воздух изнутри и сложите пополам дважды, чтобы получить узкую длинную полоску. Полученную полоску намотайте на два пальца, а ручками обмотайте полученную трубочку или рулон. Теперь, когда мы рассмотрели, как удобно складывать пакеты и майки, давайте узнаем подробнее, где их хранить.

Где хранить пакеты

На сегодняшний день можно выделить несколько мест, куда можно складывать пакеты. Наиболее традиционными считается ненужная картонная коробка или ящик стола. Кроме того, для хранения можно использовать специальный накопитель или органайзер, который можно купить в хозяйственном отделе или магазине. Он представляет устройство в виде трубы с отверстием внутри либо коробку с отверстиями в стенках, через которые удобно доставать объекты.

Пакет заворачивают в трубочку и убирают в отверстие, при этом ручки оставляют остались снаружи. Следующий объект вдевают в эти ручки и затем убирают в отверстие, тоже вытаскивая ручки наружу и оставляя так. Каждое последующее изделие вставляют по аналогии. Такой метод позволяет очень удобно хранить и легко доставать объекты с ручками.

Кстати, вы можете сделать такое устройство самостоятельно, взяв картонную или металлическую коробку цилиндрической формы. Это может быть коробка из-под чипсов, чая, бытового средства, контейнер из-под салфеток, печенья или конфет. Перед применением обязательно промойте и почистите емкость. Если коробка слишком большая в диаметре, проделайте отверстие в крышке.

Для хранения также можно применить пластиковую бутылку из-под газированной воды, напитков, сока или пива. Подходящим вариантом станет двухлитровая емкость. Давайте узнаем, как сделать такую “пакетницу” и как компактно сложить пакеты в бутылку.

Как хранить пакеты в бутылке

Возьмите пластиковую бутылку объемом не менее литра, тщательно промойте и просушите. Срежьте дно и верхнюю часть на расстоянии 10-12 сантиметров ниже горлышка. Острые края затрите мелкой наждачной бумагой. Таким образом, получится устройство, в которое через дно можно складывать пакеты, а доставать — через расширенное горлышко.

Вы также можете использовать и другой способ, срезав и обработав только горлышко тары. В этом случае пакеты, предназначенные для хранения, разравнивают и сворачивают в узкую ленту. Для этого возьмите майку с ручками и разгладьте материал. Ручки отворачивают в сторону, а основную часть скручивают в рулон.

Когда дойдете до середины, берите следующее изделие и укладывайте сверху, уже не отворачивая ручки. Продолжайте сворачивать. Таким образом, ленты скручиваются в пакетный “ролл” и полученный рулон кладется в подготовленную бутылку.

У первой майки ручки сложите и вытяните так, чтобы они были видны из горлышка. Чтобы достать пакетик, просто потяните ручки вверх. В итоге объект легко выходит из бутылки и тянет за собой следующий. При этом такая бутылка не занимает много места.

Как сложить пакеты компактно: треугольником, трубочкой, в коробку

Полиэтиленовый пакет – это простая, но крайне нужная вещь, без которой обойтись нельзя, однако скопление целлофана создает в доме беспорядок. Отсюда появляется логичный вопрос, как компактно сложить пакеты. Можно ли разместить целлофановые изделия так, чтобы не мешали, не доставляли хлопот и были доступны. О способах хранения, вариантах сворачивания пластиковых пакетов, будет рассказано в статье.

Способы складывания пакетов

Кульки, мешочки, пакетики (бумажные, вакуумные, подарочные) появляются в доме ежедневно. Мы приносим их из магазина с продуктами и другими покупками, приобретаем отдельно. В итоге на кухне начинает скапливаться множество мешочков, свернутых, скомканных, занимающих немало места. Можно их сложить компактно в коробку, например, из-под подарка, или убрать в один общий пакет, но так они могут сильно помяться. Есть немало вариантов того, как можно свернуть мешочки своими руками, чтобы было удобно вытаскивать из хранилища.

Нередко случается так, что от неправильного хранения, мешочки портятся, рвутся. Во избежание проблем стоит уметь аккуратно складывать пакеты. Есть ряд надежных способов.

Этот способ подходит для неплотных пакетов

Метод «треугольник»

Пошаговая инструкция:

1. Пакет разместить на столе и выровнять.
2. Свернуть вдвое по длине.
3. Проделать это действие 2 раза.
4. Загнуть нижний угол полоски, образовавшейся при сгибе, и продолжить складывание в виде треугольника.
5. Получается, целлофановый мешок занимает очень мало места.

Отдельно стоит рассказать о том, как можно сложить пакет треугольником, если у него есть ручки. Нужно заправить ручки внутрь сложенного кулька, и получится тот же треугольник. В дальнейшем все треугольники стоит поместить в емкость, чтобы не мешали в быту.

Это один из наиболее компактных методов хранения пакетов

Складывание трубочкой

Еще один простой вариант получения компактно сложенного пакета – это методика «трубочка». Свертывать их таким образом просто. Для этого потребуется расправить и сложить мешок пополам и потом накрутить на 2 пальца. Ручки нужно обмотать вокруг мешочка.  Скрученные трубочки остается поместить в банки или сложить друг на друга.

Главной целью такого сворачивания является освобождение места, но в процессе складывания целлофановых изделий можно к тому же выбросить ненужные и порванные кульки.

Этот метод удобнее применять для плотных и больших пакетов

Использование накопителей

На сегодняшний день есть много разных вариантов хранения мешочков. Продаются специальные банки, контейнеры, пакетницы, куда можно помещать уже свернутые мешки. В качестве примера, приведем несколько способов.

Готовые накопители

Суть такого варианта заключается в том, что можно аккуратно и красиво упаковывать мешочки, майки и даже мусорные пакеты, чтобы в дальнейшем иметь возможность их быстро достать.

Бутылка

Еще один способ – использование бутылки (лучше пластиковой). Нужно прикрепить емкость к любой дверце на кухне, а в нее упаковать заранее сложенные мешки. Размер емкости стоит выбирать с учетом того, какое количество целлофановых изделий есть у хозяйки. Предварительно нужно срезать дно и верхнюю часть бутылки на расстоянии 8-10 см ниже горлышка. Острые края лучше затереть наждачной бумагой.

Получается емкость, куда помещаются пакеты через широкое дно. Для этого их следует разгладить и скатать из мешочков большой рулон, чтобы ручки были видны из горлышка бутылки. Приведенный способ позволяет сложить пакеты так, чтобы вытягивать их в дальнейшем один за другим через узкое горлышко бутылки, заменяющей собой пакетницу. Для этого потребуется потянуть за ручку мешочка.

Применение бутылки

Коробка

Достаточно поместить пакеты в картонную коробку по всей длине и разровнять. Для удобства следует оставить отверстие диаметром 1-2 см, а ручки маек вытянуть снаружи. В дальнейшем достаточно будет потянуть за ручку и вытащить мешочек. Такой вариант подходит именно для пакетов-маечек.

Принимая во внимание, что мешки помещаются в емкость для хранения, стоит позаботиться о том, чтобы они были правильно сложены и в дальнейшем доступны для вытягивания. Все представленные варианты накопителей очень удобны, поэтому хозяйкам остается выбрать подходящий.

Накопители и специальные приспособления очень удобны и не занимают много места

Идеи хранения

Многие люди даже не спрашивают, как хранить мешочки на кухне, а пользуются старым, проверенным методом — пакет с пакетами. Такой вариант, конечно, очень прост, достаточно складывать мешки в один общий пакет, но все же его нельзя назвать практичным.

Часто возникает ситуация, когда нужен пакет, но взять его быстро не получается, потому что приходится в большой куче искать подходящий. Можно воспользоваться одной из идей хранения и размещения полиэтиленовых мешочков.

Идеи для хранения целлофановых пакетов

Начать стоит с разделения пакетов на 2 вида – маечки и обычные мешочки. Это позволит в дальнейшем сэкономить время на поиске подходящего по размеру и функциям варианта.

Когда разделение произошло, стоит выбрать способ хранения:

1. Можно поместить пакеты в контейнер для салфеток. Не стоит спешить и выбрасывать такую емкость после освобождения. Достаточно поместить туда полиэтиленовые мешочки и по мере необходимости пользоваться.
2. Подходит для этой цели использованная жестяная коробка из-под чая. Остается проделать отверстие снизу, и место для хранения пакетов готово.
3. Контейнер изготавливается своими руками. К примеру, взять старую вязаную вещь (отрезать рукав), вставить в него шнурок, и вот оригинальный контейнер готов.
4. Людям, увлекающимся поделками, можно сделать необычный контейнер для хранения мешочков – оригинальную куклу или цветочный горшок. Аксессуар позволит дополнить обстановку кухонного помещения.
5. Неплохим способом считается использование коробки из-под обуви. Удобство способа заключается в том, что емкость имеет подходящий формат, а значит, в нее уместится немало мешочков. На крышке сделать круглое или квадратное отверстие для доставания пакетов. Можно вырезать фигурку. Важно, что пакетики размещаются без скручивания. Если мешки немаленькие, то стоит взять коробку побольше.

Читайте также: Как правильно складывать вещи в шкафу для любителей порядка во всем доме.

Как видно из представленных способов, есть разные варианты складывания, размещения и хранения полиэтиленовых мешочков. Каждая методика и идея позволяет упаковать пакетик и разместить рядом, чтобы по мере надобности извлекать целлофан. Выбирать подходящий способ стоит с учетом личных предпочтений домохозяйки и размеров кухни. Для креативных людей нелишним будет проявить фантазию и сделать что-то необычное.

Как сложить пакеты компактно

Содержание статьи Без пакетов в жизни сложно обойтись. Их покупают специально для различных бытовых нужд, но большинство пакетиков попадают в дом вместе с продуктами и одеждой и применяются повторно. Чтобы пакеты легко было найти в нужный момент, надо научиться складывать их и хранить.

Складывание треугольником

У многих бывали ситуации, когда ищешь не мятый и не рваный пакетик и никак не можешь найти. Чтобы такого впредь не случалось, все пакеты в доме надо аккуратно сложить. Сделать это совсем несложно.

• Возьмите в руки пакет и разровняйте на столе или полу.
• Сложите пополам вдоль длины. Сделать это надо 2 раза, чтобы получилась узкая полоска.
• Загните нижний угол у полоски и продолжайте складывать треугольником, заворачивая его то влево, то в право.
• В результате у вас образуется пухлый уголок, который занимает совсем мало места.

Если пакет с ручками, то их можно заправить внутрь уголка. Такие манипуляции надо провести со всеми бывшими в употреблении пакетиками. Образовавшиеся треугольники можно хранить в специальной пакетнице, в ящике стола или картонной коробке.

Скатывание в трубочку

Еще проще скатать тонкий пакет-майку в трубочку. Для этого необходимо разровнять его, сделать плоским и аккуратно сложить в узкую полоску, точно так, как в способе складывания треугольником. Далее эту полоску надо намотать на два пальца, а ручки обернуть вокруг образовавшейся трубки.

После того как вы скатаете все тонкие пакеты, они будут занимать значительно меньше места. Их можно хранить в банке из-под чая или в любой другой емкости с крышкой. В нужный момент упаковочный материал всегда будет под рукой.

Если пакеты большие и жесткие, то можно сложить пополам и поставить в одну коробку рядком. Одновременно надо проводить осмотр и сразу же выбрасывать дырявые или сильно испачканные экземпляры. Вероятность того, что вы их повторно будете использовать, стремится к нулю.

Никогда не храните пакеты, в которых лежало мясо или рыба. Они будут распространять неприятный запах и могут стать источником размножения бактерий. Проверяйте, чтобы внутри не было остатков пищи, крошек, влаги. От этого внутри может заводиться плесень и насекомые.

Накопители

Есть специальные накопители для пакетов, которые позволяют их компактно хранить и легко доставать один за другим. Такой накопитель можно купить в магазине или сделать из пустой коробки из-под бумажных полотенец для рук. В коробке есть узкое отверстие, позволяющее доставать салфетки.

• необходим сложить пакет в узкую полоску и засунуть его в коробку так, чтобы выглядывали только ручки;
• следующий пакет плоско складывают, протягивают через торчащие ручки предыдущего и засовывают в коробку, опять оставляя снаружи только ручки;
• процесс повторяется, пока коробка не будет заполнена или пока не закончатся пакеты.

Накопители можно сшить из ярких лоскутков или связать в виде длинной трубы. Один конец трубы должен быть свободным, а в другой вшивается резинка, которая не дает содержимому выпасть наружу. Пакеты в них засовывают с одной стороны, а достают с другой.

Накопитель из бутылки

Валяющиеся по дому пакеты можно компактно сложить в пластиковую бутылку. Если приглядеться, то она похожа на отличный накопитель, надо только срезать дно. Чем больше в доме пакетиков, тем больше потребуется бутылка. Обычно используют емкость на 2 литра.

Для удобства горлышко тоже отрезают, чтобы расширить отверстие, а края затирают наждачной бумагой. С широкой стороны пакеты засовывают в бутылку, а с узкой стороны их достают. Получается своеобразный дозатор, которым удобно пользоваться и хранить на полке кухонного шкафа

Еще удобнее будет, если прикрепить такую бутылку с внутренней стороны дверцы мойки. Сделать это можно с помощью двустороннего скотча. Там, под мойкой, обычно стоит мусорное ведро. Можно будет доставать старый пакет и сразу же использовать его по назначению, то есть для мусорного ведра.

Лайфхак, как хранить и сложить пакеты компактно на кухне, чтобы вытягивать

Автор Софья На чтение 4 мин. Просмотров 1.2k. Опубликовано 27.03.2020 Обновлено 27.03.2020

Мы поборолись с пакетом пакетов очень просто: истратили их на помойные вёдра, а в сумочку / задний карман сложили по хозяйственной сумке из тонкой прочной ткани (и перестали брать пакетики в магазине). Но так мы поборолись с большими пакетами, осталась куча маленьких, от весовых конфет, фруктов типа яблок и т.п. Я нашла лайфхак, как хранить пакетики компактно, а потом ещё один – как хранить их в «салфетнице», чтобы они вытягивались друг за другом.

Компактные треугольники

Этот способ особенно хорош для пакетов-маечек. Удобно тем, что в любой момент захватываешь такой целлофановый треугольник и отправляешь в задний карман – не мешает. Недостаток метода – сами треугольники рассыпаются, нужно будет подобрать им органайзер или пластиковую коробку из «ФиксПрайса».

Инструкция:

• Разгладить и расправить пакет, выгнать воздух.
• Свернуть в полосу 4–5 см, приглаживая так, чтобы уходил воздух.
• Загнуть угол и сворачивать, накручивая пакет на получившийся треугольник – не забываем всё приглаживать и приминать, избавляясь от воздуха (так кулёк тоньше получится).
• Заправить оставшийся уголок в «кармашек» внутри треугольника.
• Если остались торчать ручки – накинуть на кулёк или заправить внутрь.

Этот способ для маленьких полиэтиленовых пакетов мне не понравился, а вот «маечки» и большие пакеты сворачиваются так отлично.

«Салфетница»

Тут ещё всё проще:

• Разравниваем и разглаживаем пакет.
• Складываем в аккуратную полоску нужной ширины (чтобы итоговый рулон поместился в подготовленную «салфетницу»), не забываем выгонять воздух.
• Выгоняя воздух, сворачиваем рулет.
• Когда до конца пакета остаётся примерно 10 см, кладём сверху полоску из следующего пакета и продолжаем делать красивый целлофановый рулет.
• Так справляемся со всеми пакетами или до тех пор, пока толщина не сравняется с толщиной «салфетницы».
• Из середины выправляем кончик.
• Отправляем в «салфетницу» или стягиваем рулон из пакетов канцелярской резинкой. Готово!

Во что сложить рулон из пакетов:

• в колбу от салфеток для оргтехники;
• В пластиковую бутылку со срезанным (чтобы доставать проще) горлышком или в целую;
• в бутылку с прорезью в боку.

У нас дома завалялась коробка из-под бумажных носовых платков, поэтому мы сделали не рулеты, а брикеты. Получилось даже красиво, и, в отличие от бутылок, не падает и не катается по выдвижному ящику:

• Разравниваем пакет, избавляемся от воздуха в нём.
• Складываем из него такой квадрат, чтобы он в два раза был шире коробки.
• Кладём сверху второй расплющенный пакет-квадрат, чтобы он закрыл половину предыдущего.
• Складываем нижний пакет пополам (он «закусываем» половину верхнего).
• И продолжаем укладывать и сгибать квадраты, чтобы они закусывали половину друг друга.
• Вставляем в салфетницу и выправляем кончик.

Тут вот видео, потому что проще увидеть, как складывать салфетки в салфетницу:

Как сложить подарочные пакеты

Чтобы удобно хранить подарочные пакеты их сначала нужно правильно сложить:

• Заправляем боковинки внутрь.
• Загибаем донышко – получается компактный прямоугольник.
• Заправляем внутрь пакета ручки.

Дальше, ели пакет глянцевый, лучше держать не расправленным, уложив на дно ящика или поставив вертикально в стопку «собратьев». Либо свернуть слабым рулетом и хранить вертикально.

Если пакет матовый, то можно сложить его пополам и поставить в прозрачный ящик или пластиковую корзину для мелочей из «ФиксПрайса», с «АлиЭкспресса» и т. п.

Пример того, что будет с глянцевым пакетом, если вы, как я по неразумению, будете хранить его сложенным пополам:

Словом, не делайте так.

Техника безопасности:

• пакеты из-под мяса, курицы, рыбы – сразу выкидывайте;
• пакеты из-под хлеба тщательно вытряхивайте, а лучше ополаскивайте и высушивайте;
• мокрые и влажные пакеты сушите, если сложить так, то стухнут или вообще плесень пойдёт.

Ну, вот, надеюсь, пригодятся лайфхаки. Нам они освободили кучу места. Храним их в салфетнице, а отправляясь в магазин за весовым товаром (если вспоминаем взять), складываем треугольником и в карман джинсов или сумочки.

Как сложить пакеты? Удобно и компактно, 5 способов!

В этой статье мы разберемся как же сложить полиэтиленовые пакеты так, чтобы они занимали как можно меньше места.

Мы, как компания, которая более 10 лет занимается изготовлением и печатью логотипов на пакетах, просто обязаны поделиться с вами этими секретами.

Каждый из вас хоть раз в жизни в быту или на кухне сталкивался с вопросом  — Как компактно сложить пакеты?

Придумать множество лафхаков конечно можно, но мы разберем самые популярные методы как правильно сложить пакеты:

1. Как сложить пакет треугольником;
2. Как сложить пакет петелькой;
3. Как сложить пакет в коробку, чтобы вытягивать;
4. Как сложить пакеты в бутылку;
5. Как сложить полиэтиленовые пакеты банан.

Итак разберем каждый из методов пошагово:

Как сложить пакет треугольником?

Данный метод подходит для складывания пакетов типа майка любой плотности и размера.

1. Освобождаем пакет от продуктов и лишнего мусора и пыли;
2. Разглаживаем пакет на столе;
3. Аккуратно и тщательно выравниваем все складки и выгоняем воздух из пакета;
4. Выравниваем ручки пакета;
5. Складываем наш пакет по длинной стороне на всю ширину;
6. Повторяем процедуру пока у нас не получится полоска из пакета шириной 5см;
7. Снизу начинаем сворачивать нашу «полосу» треугольником, заворачивая край от угла к длинной стороне;
8. Повторяем процедуру двигаясь к ручкам пакета направляя движения влево и вправо;
9. Оставшиеся кончики ручек нужно заправить в кармашек, который образовался.

Данный способ не занимает много времени, и теперь пакеты можно компактно складывать в любую емкость или коробку.

Как сложить пакет петелькой?

Данный метод также лучше всего подходит для упаковки пакетов майка

1. Освобождаем пакет от продуктов и лишнего мусора и пыли;
2. Разглаживаем пакет на столе;
3. Аккуратно и тщательно выравниваем все складки и выгоняем воздух из пакета;
4. Выравниваем ручки пакета;
5. Складываем наш пакет по длинной стороне на всю ширину, так, чтобы ручки пакета остались свободными;
6. Повторяем процедуру пока у нас не получится полоска из пакета шириной 5см;
7. Далее берем за низ пакета и начинаем наматывать нашу «Полоску» на два пальца, указательный и средний;
8. Наматываем до ручек пакета;
9. Расправляем ручки и продеваем наш намотанный пакет в отверстия ручек.

Данный способ еще более быстрый нежели способ треугольника, и в компактности ему вовсе не уступает.

Как сложить пакеты в коробку, чтобы вытягивать?

Очень рациональный способ укладывать пакеты в коробку, а также их очень удобно и быстро использовать.

Если у вас есть коробка из под салфеток, в которой уже есть отверстие, то уложить в нее пакеты будет проще простого.

Также подойдет любая коробка, в которой вы сможете самостоятельно прорезать отверстие размером 10см на 2см.

Порядок действий будет такой:

1. Накрываем коробку крышкой с прорезанным отверстием;
2. Выравниваем пакеты руками;
3. Укладываем пакет в коробку таким образом, чтобы ручки остались снаружи;
4. Выравниваем следующий пакет и укладываем в коробку;
5. Нижнюю часть пакета продеваем в отверстия ручек предыдущего и просовываем в отверстия коробки, оставляя ручки снаружи;
6. Проделываем процедуру пока не упакуем все пакеты.

Ручки последнего упакованного пакета оставляем снаружи коробки. И теперь чтобы достать пакет достаточно потянуть за ручки, достаем пакет а ручки следующего автоматически высовываются наружу.

Как сложить пакеты в бутылку?

Для данного способа лучше взять бутылку с широким горлышком. Лучше использовать бутылку от сока объемом от 1л. Чем больше пакетов вы хотите упаковать, тем больший объем тары нужно использовать.

Рассмотрим все шаги упаковки данным методом:

1. Подготавливаем бутылку, моем и высушиваем;
2. Ножницами ровно отрезаем верхнюю часть бутылки, на расстоянии около 10см от горлышка;
3. Пакеты складываем в узкую полоску, как при методе треугольника;
4. Начиная от низа сворачиваем пакет в трубочку, и дойдя до ручек, вкладываем следующий пакет в наш «рулон»;
5. Повторяем процедуру со всеми пакетами, которые нужно упаковать, чтобы получился рулон из пакетов;
6. Получившийся рулон вставляем в бутылку;
7. Накрываем нашу бутылку верхней частью, отрезанной ранее;
8. Середину рулона вытягиваем из горлышка бутылки.

Диспенсер пакетов готов. Таким образом вытягивая один пакет он автоматически вытягивает за собой следующий и тд. Такой органайзер занимает очень мало места и очень удобен в использовании.

Данный способ подойдет для упаковки полиэтиленовых пакетов типа банан. Если у вас скопилось большое количество таких пакетов, то данный метод поможет вам сэкономить место.

Итак разберем пошагово данный метод упаковки:

1. Освобождаем пакет от продуктов и лишнего мусора и пыли;
2. Разглаживаем пакет на столе;
3. Аккуратно и тщательно выравниваем все складки и выгоняем воздух из пакета;
4. Подгинаем низ пакета шириной 5см, переворачиваем пакет и опять подгинаем низ на 5см;
5. Затем визуально делим пакет на 3 части и подворачиваем сначала левую часть в центр, затем правую часть;
6. После продолжаем подворачивать низ пакета пока не дойдем до ручек;
7. Далее сворачиваем уголки ручек и прячем их в образовавшийся кармашек.

Готово, пакет банан упакован!

Можете сами оценить как много места освободилось после упаковки пакетов и как удобно их теперь использовать.

лайфхаки, идеи и правила хранения

Способы организации пластиковых пакетов

Перед тем, как расположить и удобно хранить пакеты, их нужно тщательно рассортировать.

Каждый пакет нужно рассмотреть и распределить их на три группы:

• те, что используются в хозяйстве;
• имеющие повреждения и разрывы;
• используемые в качестве сумок.

После такой ревизии можно увидеть, что значительная часть полиэтиленовых и целлофановых пакетов отправится в мусорку. Как правило это порванные или испачканные мешки, которые непригодны для повторного применения.

Пакеты, уже использованные ранее, но еще имеющие опрятный вид, могут быть применены для походов в магазин. Их следует удобно расположить в прихожей. Для этого можно подобрать красивую коробку или плетеную корзину, это поможет сложить мешки опрятно. В сети можно найти различные видео-идеи и лайфхаки, как правильно и эргономично хранить пакеты.

Использование коробки

Красивую и удобную коробку, которая осталась с праздника или была приобретена вместе с каким-либо товаром, можно приспособить для того, чтобы хранить полиэтиленовые изделия в кухне. Использованные пакеты закладывают в картонную коробку, предварительно вырезав в ней широкое отверстие, чтобы было удобно доставать пакет. Этот лайфхак позволит иметь постоянный быстрый доступ к пакетам небольшого размера.

Можно правильно использовать коробки от бумажных носовых платков, сложив в них пакеты нужного размера. Они не займут много места на кухне и позволят аккуратно хранить пакеты, рассортировав их по размерам.

Органайзеры из ткани

Для реализации этого лайфхака придется вооружиться элементарными знаниями и инструментами для рукоделия. Из плотной ткани нужно сшить мешок цилиндрической формы. Внизу должно быть небольшое отверстие, его можно стянуть шнурком, а вверху небольшая тканевая ручка, чтобы подвесить мешок.

В это изделие складывают пакеты одного размера, предварительно аккуратно расправленные и сложенные в квадраты. Такой способ позволяет удобно хранить пакеты в кухне, не занимая места и правильно пользоваться ими при необходимости.

Пластиковые бутылки в дело

Использованные пластиковые бутылки также могут пригодится, и часто применяются в бытовых лайфхаках. Эта идея одна из самых уникальных и удобных для того, чтобы хранить полиэтиленовые пакеты. Их нужно сворачивать таким образом, чтобы было удобно их доставать.

Пластиковые бутылки можно расположить в разных укромных уголках кухни и хранить пакеты незаметно от окружающих. Доставать из такого органайзера мешок будет просто и удобно, а главное быстро

Это немаловажно в условиях быстрых сборов

Другие идеи

В целях экономии места на кухне можно использовать различные предметы, которые на первый взгляд являются ненужным мусором. Идеи, где хранить пакеты приходят домохозяйкам периодически и представляют собой неиссякаемый источник.

Так, например, можно использовать освободившиеся картонные тубы правильно. Такие трубки остаются от рулонов бумажных полотенец, фольги или бумаги для выпекания. Скрученные улиткой пакеты нужно просто вложить в середину трубки, плотно набив им картонный остаток. Единственным минусом такой идеи является небольшой объем полиэтиленовых изделий, которые можно положить внутрь.

Также хранить пакеты в кухне можно с помощью различных банок, вертикальных коробок от чипсов, детского питания и другой подобной утвари. Идея схожа с коробками от носовых платков, сложив пакеты одного размера улиткой, их закладывают внутрь банки и протягивают кончик первого пакета сквозь дыру в крышке. Вытягивать пакеты друг за другом будет удобно, и такой метод позволит минимизировать пространство, занимаемое использованным полиэтиленом.

https://youtube.com/watch?v=446kpgpWV3Y

Кухня должна быть местом, где уютно и комфортно находится. Для этого каждый предмет должен находиться на своем месте. Организовать правильное хранение полиэтиленовых пакетов является одним из основных пунктов для обеспечения порядка в помещении.

Где хранить пакеты в квартире

Перед обустройством места хранения рассортируйте пакеты. Удобнее всего систематизировать полиэтиленовую тару по назначению.

Фасовочные	Пригодятся для похода за покупками, сортировки вещей для хранения или их упаковки в путешествие. Чтобы пакеты всегда были под рукой, храните их в ящике кухонного гарнитура.
С завязками	Отлично справляются с функцией мешка для мусора, поэтому держать их лучше недалеко от мусорного ведра.
Майки	Подойдут для походов на рынок или в магазин. Их можно сложить в прихожей или на кухне.
Бумажные (оставшиеся от шопинга)	Можно использовать для хранения мелких аксессуаров или одежды в спальне, гардеробной или детской.
Подарочные	Пригодятся для упаковки поделок, сделанными своими руками или в качестве заготовок для детских аппликаций. Держать их лучше в сухом недоступном для маленьких детей месте, чтобы они их не испортили.

Как можно сложить пакет

Самый простой вариант – скрутить мешок в трубочку, а потом завернуть в клубочек. Даже самые большие пакеты выглядят компактно и могут быть уложены в корзину или ящик. Еще одно решение – это складывание пакетов в виде треугольников, занимающих минимум места благодаря своей плоской форме. Альтернативой может стать простое складывание квадратиком, чтобы пакеты стали плоскими.

Самый утопичный вариант – просто утрамбовать полиэтилен в другой пакет. Место такая композиция будет занимать очень много.

Выбрасывать жалко, да и не рекомендуется. Поскольку полиэтилен вредит окружающей среде. Лучше сохранить их и в дальнейшем использовать в хозяйстве.

Классификация

В нашем жилище (будь то квартира, или загородный дом) поселились верные помощники хозяек – пластиковые пакеты. Сегодня это самая удобная упаковка. В супермаркетах её предлагают бесплатно. Бонус производит приятное впечатление и является приоритетным в выборе магазина. По форме упаковку делят на несколько видов:

• “майка” – самый распространенный. Удобен в использовании, обладает большой вместимостью (за счет складок по бокам) и приемлемой ценой;
• с прорезным отверстием – более дорогой. Приобретается для упаковки подарков, деловых бумаг, в виде рекламы. Отличаются более прочным материалом и выглядят представительно;
• самый хороший вариант – кульки для фасовки. Применяются для сыпучих продуктов и мелкого товара.

Советы и рекомендации

С каждым новым походом в магазин количество пакетов в доме становится на порядок больше. Чтобы не погрязнуть в тонне полиэтилена, нужно воспользоваться несколькими простыми правилами:

• Перед укладыванием на хранение пакетов на кухне нужно проверять их на целостность. Те, на которых есть даже небольшие дырочки, нужно отправлять в утиль. Желательно не выбрасывать их в мусорное ведро, а сдавать в специальные перерабатывающие центры.
• Если есть возможность, полиэтиленовые мешки лучше заменить на биоразлагающиеся, из органических материалов.
• Пакеты, которые планируется хранить длительное время, должны быть идеально чистыми, без липких пятен. В противном случае они могут склеиться между собой, образуя сплошной полиэтиленовый ком. Тогда выкинуть их придется все.

Полиэтиленовые пакеты впрок должны быть в любом доме. Задача хорошей хозяйки – уложить их таким образом, чтобы они не занимали места. Иногда пакеты можно обыграть идеями с помощью причудливого контейнера или другого приспособления, которое станет достойным элементом интерьера и украсит собой помещение.

Виды пакетиков

Всего в продаже представлено огромное множество пакетов, начиная от мусорных, заканчивая самыми миниатюрными бутербродными. Как правило, в хозяйстве используются несколько видов пакетов:

• Одноразовые маленькие. Используется для упаковки детских завтраков в школу, для хранения продуктов в холодильнике.
• Хозяйственные переносные. Ими пользуемся, когда идём за покупками в продуктовый магазин. Часто, забывая взять с собой очередной пакет, снова покупаем в супермаркете полиэтиленовую сумочку. Итого дома их собирается великое множество.

Выбрасывать жалко, да и не рекомендуется. Поскольку полиэтилен вредит окружающей среде. Лучше сохранить их и в дальнейшем использовать в хозяйстве.

Мусорные. Самые огромные. Часто они лежат в рулоне и используются по мере необходимости. Не занимают много места, если хранятся в первозданном товарном виде.

Порядок на маленькой кухне

Маленькая кухня — это не проблема, если знать, как грамотно навести порядок и каким образом можно максимизировать свободное пространство.

Дверцы шкафов

На дверцы шкафа можно присоединить специальные крючки, держатели. Главное проследить, чтобы при закрытии вещи не контактировали с полками, иначе они не закроются. Также способ распространяется на легкие вещи, поскольку тяжелые предметы могут сломать держатель.

Торцы и внешние стенки кухонной мебели

Эти полезные приспособления способны выдержать как прихватки с полотенцами, так и тяжелые предметы: доски, сковородки, различные баночки с маслами

Важно выбрать прочные держатели и хорошо их закрепить

Внутренние станки шкафов

Внутреннюю стенку шкафов также можно оснастить различными крючками. На них удобно подвешивать легкие предметы: наборы мерных ложек, насадки для бытовых устройств, надобность в которых возникает редко.

Место под навесными шкафчиками

Под навесными шкафчиками можно разместить маленькие полочки для всевозможных пряностей. Для этого крышку прикрутить шурупами у нижней части шкафа и ввинтить банки с различными сыпучими продуктами.

Шкаф под потолок

На маленькой кухне, где сложно развернуться, можно воспользоваться свободным местом от шкафчика до потолка, установив там дополнительную навесную мебель. Пользоваться ей неудобно, поэтому в ней рекомендуется расположить вещи, что практически не используются в обиходе, например праздничные и старые сервизы, консервацию.

Идеи предметов для хранения пакетов своими руками

Целлофановые кульки обычно складывают в кухонные ящики либо другие пакеты. Но есть и иные способы хранения таких изделий. Для этого применяют более оригинальные предметы, которые улучшают общий вид кухни.

Пластиковая бутылка

Чтобы сделать емкость для хранения целлофановых кульков, нужно:

1. Взять пластиковую бутылку достаточно объема (лучше 6-12 литров).
2. Отрезать широкое дно и верх, отступив от горлышка 8-10 сантиметров.
3. Зашкурить острые края наждачной бумагой.
4. Прикрепить бутылку при помощи самореза или клейкой ленты к стене.

Коробка

Для хранения целлофана можно использовать картонные коробки (из-под обуви или других предметов). При необходимости стенки можно задекорировать, тем самым вписав изделие в интерьер. Для небольших кульков используют компактные коробки из-под салфеток.

Сумка

Для хранения пакетов на кухне в магазинах продаются специальные сумки из плотного материала, которые крепятся к стенам или шкафам. Этот вариант удобен тем, что в данных изделиях предусматриваются отверстия, через которые легко достаются кульки. Наиболее удачно такое решение для тех случаев, когда возникает необходимость в создании места для хранения фасовочных пакетов в рулоне.

Также сумки можно сделать своими руками. Для этого нужно взять плотную ткань и прошить вдоль краев так, чтобы получилась требуемая емкость.

Кукла

Это оригинальный и достаточно популярный вариант для хранения кульков в доме. Кукол можно пошить самостоятельно либо купить в магазине. В таких игрушках пакеты хранятся под пышной юбкой, в отдельном мешочке. Куклы крепятся к стойке либо стене.

Если нет времени или навыков, необходимых для изготовления подобных игрушек, то можно пошить мешок из красивой ткани, внешне напоминающей пышное платье.

Пакет с пакетами

Этот вариант наиболее популярен в домах. Однако хранение пакетов таким способом портит общий облик кухни. Кроме того, отдельно висящий и заполненный кулек занимает много места и нередко мешает передвижению по помещению. При этом данный вариант позволяет освободить ящики на кухне и не требует ни временных, ни финансовых затрат (за исключением расходов, связанных с покупкой крупного пакета).

Картон

Картонные изделия открывают простор для фантазии. Для хранения целлофановых кульков применяют коробки из-под молока и другие. При желании можно самостоятельно изготовить такую емкость, склеив части картона. Получившиеся изделия размещают на столах, в шкафах и других местах, удобных для хранения пакетов.

Контейнер

Как и в случае с куклой, этот вариант считается наиболее удачным, так как пластиковый контейнер улучшает внешний вид кухни и решает проблему с хранением целлофана. Такие изделия отличаются наличием плотного корпуса и откидной крышки. Встречаются модели с прорезанными отверстиями по бокам, открывающими прямой доступ к кулькам.

Условия печати и упаковки, часть 3: складки и складки

» Назад

Иногда терминология печати и упаковки может показаться неясной даже для опытных профессионалов отрасли. В JohnsByrne мы стремимся упростить этот аспект вашего бизнеса, чтобы вы могли сосредоточиться на создании отличных продуктов.

Когда дело доходит до структурного дизайна, многие дизайнеры упаковки не осознают, сколько вариантов им доступно. Возможности практически безграничны. Один из способов создать более яркую и неповторимую упаковку — это поэкспериментировать с различными типами складных контейнеров.Но как узнать, какой тип коробки или картонной коробки лучше всего подойдет для вашего дизайна или идеи упаковки? Хотя мы можем работать с вами, чтобы выбрать идеальный процесс печати для вашего продукта, различные типы коробок могут немного сбивать с толку, если вы не знакомы с терминологией. Для начала мы собрали некоторые из наиболее широко используемых типов упаковочных картонных коробок:

1-2-3 Картонная коробка с нижним фиксатором

Этот стиль, первоначально названный Houghland в честь его изобретателя, сегодня является одним из наиболее широко используемых контейнеров.Иногда ее называют застежкой 1-2-3, она используется почти исключительно как нижняя застежка, как правило, в сочетании с застежкой-складкой сверху. Это закрытый стиль ручной сборки. Этот стиль обычно используется в качестве нижней крышки для неглубоких продуктов в виде трубки. Вариант, известный как Snap Lock Bottom, обеспечивает дополнительную безопасность и идеально подходит для более тяжелых продуктов.

Шестиугольный лоток

Шесть угловых подносов идеально подходят для различных предметов, включая различные типы продуктов питания, электроники и ящиков для обуви.Ширина крышки в два раза больше ширины дна. Конструкция из четырех угловых лотков, разработанная для ручной установки и загрузки, автоматически склеивается и может быть отправлена ​​в плоском виде. Они также идеально подходят для приложений, в которых продукт должен быть упакован непосредственно в транспортировочный лоток.

Шестигранный поднос для пива

Также имеется четырехугольный складной лоток из картона с углами, скрепленными клеем или клеем.При изготовлении лоток складывается плоско для экономии места при транспортировке и хранении. Каждый угол надрезается по диагонали, боковые стороны лотка складываются внутрь в сложенное положение.

Картонная коробка с прямым складыванием в стиле самолета

В этом стиле есть закрывающиеся панели сверху и снизу, которые откидываются сзади и складываются спереди. Прямая складка самолета отличается от стандартной прямой складки тем, что верхняя и нижняя закрывающие панели складываются сзади вперед.Этот контейнер также может быть изготовлен с фрикционной посадкой или щелевым замком для более надежного закрытия.

Конец коробки передач самолета

Иногда называемый SNT или Straight Notched Tuck, этот контейнер имеет защипы с фрикционной посадкой или береговыми замками для более надежного закрытия. Вытяжки могут быть на второй или четвертой панели в зависимости от ваших предпочтений в презентации.

Поднос с четырьмя углами из светлого дерева

Этот стиль поставляется в плоском виде и отклеивается производителю, который затем собирает и склеивает его в автоматическом процессе.Поднос Four Corner Brightwood, простой в использовании и сборке, идеально подходит для быстрой массовой сборки.

Вытяжка и язык

Этот фасон обычно собирается, заполняется и запаивается вручную. Картонная упаковка Tuck and Tongue с прочной конструкцией выдерживает грубое обращение без вскрытия. Он включает в себя фиксатор на верхней закрывающей панели для усиления. От роскошной розничной упаковки до простых нестандартных коробок с логотипом — это широко используемый стиль коробки, подходящий для широкого спектра относительно легких продуктов.

Tuck Top Auto Lock Bottom Box

Эта предварительно склеенная складная картонная коробка имеет дно, состоящее из нескольких загнутых створок, которые образуют композитную нижнюю панель, когда картонная коробка собирается. Расширенный верхний клапан заправляется внутрь и удерживается на месте за счет трения или фиксируется в нужном положении. Вытяжки могут иметь фрикционную посадку или береговые замки для более надежного закрытия. Склеенное дно также позволяет ящику выдерживать более тяжелые продукты.

Нижняя коробка с защелкой сверху и защелкой

Этот стиль похож на верхнюю автоматическую нижнюю часть, но без предварительно приклеенного низа.Настраиваемая нижняя часть защелкивающейся верхней защелки имеет четыре створки, которые складываются и фиксируются, образуя нижнюю часть. Хотя производство, как правило, обходится дешевле, сборка может занять больше времени.

Индивидуальные решения для печати

JohnsByrne предлагает индивидуальные решения для печати и упаковки благодаря обширным знаниям и опыту нашей команды. С самого начала мы можем сотрудничать и понимать, какой окончательный вид вы хотите получить, а наш опыт и изобретательность позволяют создать правильное решение из правильных материалов.Свяжитесь с нами сегодня, чтобы узнать больше о нестандартных коробках, картонных коробках и других контейнерах из нашего ассортимента.

Умеренная оценка кратного изменения и дисперсии данных RNA-seq с помощью DESeq2 | Геномная биология

Модель и нормализация

Отправной точкой анализа DESeq2 является счетная матрица K с одной строкой для каждого гена i и одним столбцом для каждого образца j . Элементы матрицы K _ij указывают количество считываний секвенирования, которые были однозначно сопоставлены с геном в образце.Обратите внимание, что хотя в этой статье мы говорим о подсчете считываний в генах, представленные здесь методы также могут быть применены к другим видам данных подсчета HTS. Для каждого гена мы подбираем обобщенную линейную модель (GLM) [12] следующим образом.

Мы моделируем количество считываний K _ij в соответствии с отрицательным биномиальным распределением (иногда также называемым гамма-распределением Пуассона) со средним значением μ _ij и дисперсия α _i .Среднее значение принимается как величина q _ij , пропорционально концентрации фрагментов кДНК гена в образце, масштабированной с помощью коэффициента нормализации s _ij , т.е. мкм _ij = с _ij q _ij . Для многих приложений одинаковая константа s _j можно использовать для всех генов в образце, что затем учитывает различия в глубине секвенирования между образцами.Для оценки этих коэффициентов размера пакет DESeq2 предлагает метод медианы отношений, уже использованный в DESeq [4]. Однако может быть полезно вычислить коэффициенты нормализации для конкретных генов s _ij , чтобы учесть дополнительные источники технических ошибок, таких как различная зависимость от содержания GC, длины гена и т.п., с использованием опубликованных методов [13], [14], и они могут быть предоставлены взамен.

Мы используем GLM с логарифмической связью, log2qij = ∑rxjrβir, с элементами матрицы дизайна x _jr и коэффициенты β _ir .В простейшем случае сравнения между двумя группами, такими как обработанные и контрольные образцы, элементы матрицы дизайна указывают, обрабатывается ли образец — или нет, а соответствие GLM возвращает коэффициенты, указывающие общую силу экспрессии гена и log ₂ -кратное изменение между обработкой и контролем. Однако использование линейных моделей обеспечивает гибкость для анализа более сложных дизайнов, что часто бывает полезно в геномных исследованиях [15].

Эмпирическое байесовское сжатие для оценки дисперсии

Внутригрупповая изменчивость, i.е., вариабельность между повторностями моделируется параметром дисперсии α _i , который описывает дисперсию отсчетов через VarKij = μij + αiμij2. Точная оценка параметра дисперсии α _i имеет решающее значение для статистического вывода дифференциального выражения. Для исследований с большим размером выборки это обычно не проблема. Однако для контролируемых экспериментов размеры выборки обычно меньше (обычно и разумны экспериментальные планы с двумя или тремя повторами), что приводит к сильно различающимся оценкам дисперсии для каждого гена.При прямом использовании эти зашумленные оценки могут поставить под угрозу точность тестирования дифференциального выражения.

Одним из разумных решений является обмен информацией между генами. В DESeq2 мы предполагаем, что гены со сходной средней силой экспрессии имеют сходную дисперсию. Здесь мы объясняем концепции нашего подхода, используя в качестве примеров набор данных Bottomly et al. [16] с данными РНК-seq для мышей двух разных линий и набором данных Pickrell et al. [17] с данными РНК-seq для линий лимфобластоидных клеток человека.Математические подробности см. В разделе «Материалы и методы».

Сначала мы обрабатываем каждый ген отдельно и оцениваем оценки генной дисперсии (с использованием максимального правдоподобия), которые основываются только на данных каждого отдельного гена (черные точки на рисунке 1). Далее мы определяем параметр местоположения распределения этих оценок; чтобы учесть зависимость от средней силы экспрессии, мы построили гладкую кривую, как показано красной линией на рисунке 1. Это дает точную оценку ожидаемого значения дисперсии для генов с заданной силой экспрессии, но не отражает отклонения отдельных генов. от этой общей тенденции.Затем мы сокращаем оценки генетической дисперсии до значений, предсказанных кривой, чтобы получить окончательные значения дисперсии (синие стрелки). Мы используем эмпирический байесовский подход (материалы и методы), который позволяет силе усадки зависеть (i) от оценки того, насколько близки истинные значения дисперсии к подгонке, и (ii) от степеней свободы: в качестве образца увеличивается размер, сила усадки уменьшается и со временем становится незначительной. Таким образом, наш подход учитывает специфические для генов вариации в той степени, в которой данные предоставляют эту информацию, в то время как подобранная кривая помогает оценивать и тестировать в менее информативных условиях.

Рисунок 1

Оценка усадки дисперсии. График оценок дисперсии по средней силе экспрессии (A) для Bottomly et al. Набор данных [16] с шестью образцами из двух групп и (B) для пяти образцов из Pickrell et al. [17] набор данных, соответствующий только члену перехвата. Во-первых, генные MLEs получают с использованием только данных соответствующего гена (черные точки). Затем кривая (красная) подбирается к MLE, чтобы отразить общую тенденцию зависимости средней дисперсии.Эта аппроксимация используется в качестве априорного среднего для второго раунда оценки, что приводит к окончательным оценкам MAP дисперсии (стрелки). Это можно понять как сокращение (по синим стрелкам) зашумленных генетических оценок в сторону консенсуса, представленного красной линией. Черные точки, обведенные синим кружком, обнаруживаются как выбросы дисперсии и не сжимаются к предыдущему (усадка будет следовать за пунктирной линией). Для ясности показано только подмножество генов, которое обогащено выбросами дисперсии.Дополнительный файл 1: на рисунке S1 показаны те же данные, но с отображением дисперсии всех генов. MAP, максимум a posteriori ; MLE, оценка максимального правдоподобия.

Наш подход аналогичен подходу, используемому в DSS [6], в том, что оба метода последовательно оценивают априорное распределение для истинных значений дисперсии вокруг аппроксимации, а затем предоставляют максимальное апостериорное (MAP) в качестве окончательная оценка. Он отличается от предыдущей реализации DESeq , в которой в качестве окончательной оценки использовались максимум подобранной кривой и оценка дисперсии по генам, а дисперсии были завышены (дополнительный файл 1: рисунок S2).Подход DESeq2 отличается от подхода edgeR [3], поскольку DESeq2 оценивает ширину предварительного распределения на основе данных и, следовательно, автоматически контролирует величину сжатия на основе наблюдаемых свойств данных. В отличие от этого, шаги по умолчанию в edgeR требуют настраиваемого пользователем параметра, априорных степеней свободы , которые взвешивают вклад оценки отдельного гена и аппроксимации дисперсии edgeR .

Обратите внимание, что на Рисунке 1 для ряда генов с оценками генетической дисперсии ниже кривой окончательные оценки значительно увеличены. Таким образом, процедура усадки помогает избежать потенциальных ложных срабатываний, которые могут возникнуть из-за недооценки дисперсии. Если, с другой стороны, дисперсия отдельного гена намного превосходит распределение оценок генетической дисперсии других генов, то уменьшение может привести к сильно заниженной окончательной оценке дисперсии. Мы рассудили, что во многих случаях причина чрезвычайно высокой дисперсии гена заключается в том, что он не подчиняется нашим предположениям моделирования; некоторые гены могут демонстрировать гораздо более высокую вариабельность, чем другие, по биологическим или техническим причинам, даже если они имеют одинаковые средние уровни экспрессии.В этих случаях вывод, основанный на оценках уменьшенной дисперсии, может привести к нежелательным ложным срабатываниям. DESeq2 обрабатывает эти случаи, используя генную оценку вместо сжатой оценки, когда первая более чем на 2 остаточных стандартных отклонения выше кривой.

Эмпирическое байесовское сжатие для оценки кратности

Общей трудностью при анализе данных HTS является сильная дисперсия оценок LFC для генов с низким числом считываний. Мы демонстрируем эту проблему, используя набор данных Bottomly et al. [16]. Как показано на рисунке 2А, ​​слабо экспрессируемые гены, по-видимому, показывают гораздо более сильные различия между сравниваемыми линиями мышей, чем сильно экспрессируемые гены. Этот феномен, наблюдаемый в большинстве наборов данных HTS, является прямым следствием работы с данными count , в которых отношения по своей природе более шумные, когда счетчики низкие. Эта гетероскедастичность (дисперсия LFC в зависимости от среднего количества) усложняет последующий анализ и интерпретацию данных, поскольку затрудняет сравнение размеров эффекта в динамическом диапазоне данных.

Рисунок 2

Влияние усадки на оценки логарифмического кратного изменения. Графики оценки MLE (A) (т. Е. Без усадки) и (B) MAP (т. Е. С усадкой) для LFC, связанных с деформацией мышей, по сравнению со средней силой экспрессии для сравнения десяти образцов с одиннадцатью из Bottomly et al. [16] набор данных. Маленькие треугольники вверху и внизу графиков указывают точки, которые выходят за пределы окна построения.Два гена с одинаковым средним числом и логарифмическим кратным изменением MLE выделены зелеными и фиолетовыми кружками. (C) Подсчеты (нормализованные по размерным факторам s _j ) для этих генов обнаруживают низкую дисперсию гена в зеленом и высокую дисперсию гена в пурпурном. (D) Графики плотности вероятностей (сплошные линии, масштабированные для интегрирования до 1) и апостериорных значений (пунктирные линии) для зеленого и фиолетового генов и предшествующего (сплошная черная линия): из-за более высокой дисперсии пурпурный ген, его вероятность шире и менее острая (что указывает на меньший объем информации), и предшествующий ген имеет большее влияние на его заднюю часть, чем на зеленый ген.Более сильная кривизна зеленой задней части в максимуме приводит к меньшей стандартной ошибке для оценки MAP LFC (горизонтальная полоса ошибок). прил., скорректировано; LFC, логарифмическое кратное изменение; MAP, максимум a posteriori ; MLE, оценка максимального правдоподобия.

DESeq2 преодолевает эту проблему, сокращая оценки LFC до нуля таким образом, чтобы сжатие было сильнее, когда доступная информация для гена низка, что может быть связано с низкими счетами, высокой дисперсией или несколькими степенями свободы .Мы снова используем эмпирическую байесовскую процедуру: сначала мы выполняем обычные GLM-аппроксимации для получения оценок максимального правдоподобия (MLE) для LFC, а затем подгоняем нормальное распределение с нулевым центром к наблюдаемому распределению MLE по всем генам. Это распределение используется как предварительное для LFC во втором раунде подборов GLM, а оценки MAP сохраняются как окончательные оценки LFC. Кроме того, для каждой оценки указывается стандартная ошибка, которая выводится из максимальной кривизны задней части (подробности см. В материалах и методах).Эти сжатые LFC и их стандартные ошибки используются в тестах Вальда для дифференциального выражения, описанных в следующем разделе.

Результирующие LFC MAP смещены в сторону нуля таким образом, что устраняется проблема завышенных LFC для малых отсчетов. Как показано на рисунке 2B, самые сильные LFC больше не проявляются генами с самой слабой экспрессией. Скорее, оценки более равномерно распределены вокруг нуля, и для очень слабо экспрессируемых генов (в среднем менее одного считывания на образец) LFC практически не отклоняются от нуля, что свидетельствует о том, что точные оценки LFC здесь невозможны.

Сила усадки зависит не только от среднего числа, но, скорее, от количества информации, доступной для оценки кратности изменения (как указано в наблюдаемой информации Фишера; см. Материалы и методы). Два гена с одинаковой силой экспрессии, но разными дисперсиями будут испытывать разную степень усадки (рис. 2C, D). Уменьшение оценок LFC можно описать как компромисс между смещением и дисперсией [18]: для генов с небольшим количеством информации для оценки LFC уменьшение сильной дисперсии покупается за счет принятия смещения к нулю, и это может приводят к общему снижению среднеквадратичной ошибки, e.g., при сравнении с оценками LFC из нового набора данных. В нашем подходе гены с высокой информацией для оценки LFC будут иметь LFC с низким смещением и низкой дисперсией. Кроме того, по мере увеличения степеней свободы и получения большего количества информации для оценки LFC сокращенные оценки сходятся к нерастянутым оценкам. Мы отмечаем, что другие байесовские усилия по смягчению кратных изменений для RNA-seq включают иерархические модели [8], [19] и инструмент GFOLD (или обобщенное изменение кратности) [20], который использует апостериорное распределение LFCs.

Уменьшенные LFC MAP предлагают более воспроизводимую количественную оценку транскрипционных различий, чем стандартные LFC MLE. Чтобы продемонстрировать это, мы разделили Bottomly et al. образцов поровну на две группы, I и II, таким образом, чтобы каждая группа содержала сбалансированное разделение штаммов, моделируя сценарий, в котором эксперимент (образцы в группе I) выполняется, анализируется и сообщается, а затем независимо реплицируется (образцы в группе II). Внутри каждой группы мы оценили LFC между штаммами и сравнили между группами I и II, используя MLE LFC (рисунок 3A) и используя MAP LFC (рисунок 3B).Поскольку усадка перемещает большие LFC, которые не поддерживаются данными, к нулю, согласие между двумя независимыми группами образцов значительно увеличивается. Таким образом, оценки сокращенных кратных изменений предлагают более надежную основу для количественных выводов, чем обычные MLE.

Рисунок 3

Устойчивость логарифмических кратных изменений. DESeq2 работает на равных частях данных Bottomly et al. [16], а LFC половин нанесены друг против друга. (A) MLEs, т.е. без усадки LFC. (B) MAP оценки, т.е. с усадкой. Точки в верхнем левом и правом нижнем квадрантах указывают на гены с изменением знака LFC. Красные точки указывают на гены с скорректированным значением P <0,1. В легенде отображается среднеквадратичная ошибка оценок в группе I по сравнению с оценками в группе II. LFC, логарифмическое кратное изменение; MAP, максимум a posteriori ; MLE — оценка максимального правдоподобия; RMSE, среднеквадратичная ошибка.

Это делает уменьшенные LFC также подходящими для ранжирования генов, например, для определения их приоритетности для последующих экспериментов. Например, если мы отсортируем гены в двух группах выборки на Рисунке 3 по непревзойденным оценкам LFC и рассмотрим 100 генов с самой сильной повышающей или понижающей регуляцией в группе I, мы снова найдем только 21 из них среди 100 лучших. гены с повышенной или пониженной регуляцией во II группе. Однако, если мы ранжируем гены по уменьшенным оценкам LFC, перекрытие улучшается до 81 из 100 генов (дополнительный файл 1: рисунок S3).

Более простой часто используемый метод — добавить фиксированное число (псевдосчет) ко всем счетчикам перед формированием соотношений. Однако это требует выбора параметра настройки и реагирует только на один из источников неопределенности, низкие значения, но не на специфичные для генов различия в дисперсии или размер выборки. Мы демонстрируем это в разделе Benchmarks ниже.

Проверка гипотез для дифференциальной экспрессии

После того, как GLM подходят для каждого гена, можно проверить, отличается ли каждый коэффициент модели значительно от нуля. DESeq2 сообщает стандартную ошибку для каждой уменьшенной оценки LFC, полученной из кривизны апостериорной кривой коэффициента (пунктирные линии на рисунке 2D) в максимуме. Для проверки значимости DESeq2 использует тест Вальда: уменьшенная оценка LFC делится на ее стандартную ошибку, в результате получается статистика z , которая сравнивается со стандартным нормальным распределением. (Подробности см. В разделе «Материалы и методы».) Тест Вальда позволяет тестировать отдельные коэффициенты или контрасты коэффициентов без необходимости подгонки сокращенной модели, как в случае теста отношения правдоподобия, хотя тест отношения правдоподобия также доступен в качестве опции в DESeq2 .Значения теста Вальда P из подмножества генов, которые проходят этап независимой фильтрации, описанный в следующем разделе, корректируются для множественного тестирования с использованием процедуры Бенджамини и Хохберга [21].

Автоматическая независимая фильтрация

Из-за большого количества тестов, выполняемых при анализе RNA-seq и других полногеномных экспериментах, необходимо решить проблему множественного тестирования. Популярной целью является контроль или оценка FDR. Множественная корректировка тестирования обычно связана с потерей мощности в том смысле, что FDR для набора генов часто выше, чем индивидуальные значения P этих генов.Однако потери могут быть уменьшены, если гены, которые имеют мало шансов быть обнаруженными как дифференциально экспрессируемые или совсем не обнаружены, исключены из тестирования, при условии, что критерий пропуска не зависит от статистики теста при нулевой гипотезе [22] (см. Материалы и методы). DESeq2 использует среднюю силу экспрессии каждого гена по всем образцам в качестве критерия фильтрации и исключает все гены со средними нормализованными счетчиками ниже порога фильтрации из корректировки множественного тестирования. DESeq2 по умолчанию выберет порог, который максимизирует количество генов, обнаруженных в заданной пользователем целевой FDR. На рисунках 2A, B и 3 гены, обнаруженные таким образом как значимые при оценке FDR, равной 10%, изображены красным. В зависимости от распределения средних нормализованных показателей результирующее увеличение мощности может быть значительным, что иногда влияет на то, обнаруживаются ли какие-либо дифференциально экспрессируемые гены.

Проверка гипотез с пороговыми значениями величины эффекта

Определение минимальной величины эффекта

Большинство подходов к проверке дифференциального выражения, включая подход по умолчанию DESeq2 , проверяют нулевую гипотезу ноль LFC.Однако, если на какие-либо биологические процессы действительно влияет разница в экспериментальном подходе, эта нулевая гипотеза подразумевает, что рассматриваемый ген полностью отделен от этих процессов на . Из-за высокой взаимосвязанности регуляторных сетей клеток эта гипотеза на самом деле неправдоподобна и, возможно, неверна для многих, если не для большинства генов. Следовательно, при достаточном размере выборки даже гены с очень маленьким, но ненулевым LFC в конечном итоге будут обнаружены как дифференциально экспрессируемые.Следовательно, изменение должно быть достаточной величины, чтобы считаться биологически значимым . Для мелкомасштабных экспериментов статистическая значимость часто является гораздо более строгим требованием, чем биологическая значимость, тем самым освобождая исследователя от необходимости определять порог биологической значимости.

Для экспериментов с хорошей мощностью, однако, статистический тест против общепринятой нулевой гипотезы о нулевом LFC может выявить гены со статистически значимыми изменениями, которые настолько слабы по силе воздействия, что их можно было бы считать нерелевантными или отвлекающими.Распространенной процедурой является игнорирование генов, чей расчетный LFC β _ir ниже некоторого порога, | β _ir | ≤ θ . Однако этот подход теряет преимущество легко интерпретируемого FDR, так как заявленное значение P и скорректированное значение P по-прежнему соответствуют тесту с нулевым значением LFC. Поэтому желательно включить порог непосредственно в процедуру статистического тестирования, т.е.е., не для фильтрации апостериорной оценки кратного изменения , а скорее для прямой статистической оценки того, имеется ли достаточное свидетельство того, что LFC превышает выбранный порог.

DESeq2 предлагает тесты для составных нулевых гипотез формы | β _ir | ≤ θ , где β _ir — это сжатый LFC из процедуры оценки, описанной выше.(Подробности см. В разделе «Материалы и методы».) На рисунке 4A показано, как такой пороговый тест приводит к изогнутой границе принятия решения: для достижения значимости расчетный LFC должен превысить указанный порог на величину, которая зависит от доступной информации. Мы отмечаем, что связанные подходы к созданию списков генов, удовлетворяющих критериям статистической и биологической значимости, ранее обсуждались для данных микрочипов [23], а недавно — для данных секвенирования [19].

Рисунок 4

Проверка гипотез с использованием ненулевых пороговых значений. Показаны графики оцененного кратного изменения средней силы экспрессии («минус выше среднего» или MA-графики) для сравнения десять против одиннадцати с использованием Bottomly et al. Набор данных [16], где выделенные точки указывают на низкие скорректированные значения P . Альтернативные гипотезы заключаются в том, что логарифмические (основание 2) кратные изменения: (A) больше 1 по абсолютной величине или (B) меньше 1 по абсолютной величине. прил., скорректировано.

Определение максимального размера эффекта

Иногда исследователь заинтересован в поиске генов, на которые лечение или экспериментальные условия не влияют или влияют очень слабо.Это равносильно настройке, аналогичной только что обсужденной, но роли нулевой и альтернативной гипотез меняются местами. Здесь мы просим доказательства слабости эффекта, а не доказательства того, что эффект равен нулю, потому что последний вопрос редко разрешим. Значение слабый необходимо количественно определить для рассматриваемого биологического вопроса, выбрав подходящий порог θ для LFC. Для такого анализа DESeq2 предлагает проверку составной нулевой гипотезы | β _ir | ≥ θ , что будет указывать на гены как значимые, для которых есть доказательства того, что их LFC слабее, чем θ .На рисунке 4B показан результат такого теста. Для генов с очень низким числом считываний даже оценка нулевого LFC не имеет значения, поскольку большая неопределенность оценки не позволяет нам исключить, что на самом деле эксперимент может более чем слабо повлиять на ген. Обратите внимание на отсутствие сжатия LFC: чтобы найти гены со слабой дифференциальной экспрессией, DESeq2 требует, чтобы сжатие LFC было отключено. Это связано с тем, что предварительная установка с нулевым центром, используемая для усадки LFC, воплощает в себе представление , предшествующее , что LFC имеют тенденцию быть маленькими, и, следовательно, здесь неуместны.

Обнаружение выбросов при подсчете

Параметрические методы обнаружения дифференциальной экспрессии могут иметь генетические оценки LFC, на которые чрезмерно влияют отдельные выбросы, которые не соответствуют предположениям модели о распределении [24]. Примером такого выброса может быть ген с однозначным счетом для всех выборок, кроме одного образца с тысячами. Поскольку цель анализа дифференциальной экспрессии обычно состоит в том, чтобы найти последовательно активируемых или подавляемых генов, полезно рассмотреть диагностику для обнаружения отдельных наблюдений, которые чрезмерно влияют на оценку LFC и значение P для гена.Стандартной диагностикой выбросов является расстояние Кука [25], которое определяется в каждом гене для каждого образца как масштабированное расстояние, на которое вектор коэффициентов β → i линейной модели или GLM переместился бы, если бы образец был удален, а модель обновлена. .

DESeq2 отмечает для каждого гена те образцы, для которых расстояние Кука больше квантиля 0,99 распределения F ( p , m — p ), где p — это число параметров модели с учетом пересечения, а м — количество образцов.Использование распределения F мотивировано эвристическим рассуждением о том, что удаление одной выборки не должно перемещать вектор β → i за пределы 99% доверительной области вокруг β → i подгонки с использованием всех выборок [25]. Однако, если существует две или меньше реплик для условия, эти образцы не способствуют обнаружению выбросов, поскольку их недостаточно для определения статуса выброса.

Как поступать с помеченными выбросами? В эксперименте с множеством повторов отбрасывание выброса и обработка оставшихся данных может наилучшим образом использовать имеющиеся данные.Однако в небольшом эксперименте с несколькими образцами присутствие выброса может нарушить вывод относительно затронутого гена, и простое игнорирование этого выброса может даже считаться выборкой данных — и, следовательно, более разумно исключить весь ген из последующий анализ.

Следовательно, DESeq2 предлагает два возможных ответа на отмеченные выбросы. По умолчанию выбросы в условиях с шестью или менее повторами приводят к тому, что весь ген помечается и удаляется из последующего анализа, включая корректировку значения P для множественного тестирования.Для условий, которые содержат семь или более повторов, DESeq2 заменяет счетчики выбросов условным значением, а именно усеченным средним по всем выборкам, масштабированным по коэффициенту размера, а затем повторно оценивает дисперсию, LFC и значения P для эти гены. Поскольку выброс заменяется значением, предсказанным нулевой гипотезой об отсутствии дифференциального выражения, это более консервативный выбор, чем просто исключение выброса. Когда существует много степеней свободы, второй подход позволяет избежать отбрасывания генов, которые могут содержать истинную дифференциальную экспрессию.

Дополнительный файл 1: На рисунке S4 показана процедура замены выброса для одного гена в сравнении с семью на семь, полученным в Bottomly et al. [16] набор данных. В то время как на исходные подобранные средние сильно влияет один образец с большим количеством образцов, скорректированные LFC обеспечивают лучшее соответствие большинству образцов.

Преобразование регуляризованного логарифма

Для некоторых анализов полезно преобразовать данные, чтобы сделать их гомоскедастичными. В качестве примера рассмотрим задачу неконтролируемой оценки сходства выборки с использованием алгоритма кластеризации или ординации.Для данных RNA-seq возникает проблема гетероскедастичности: если данные передаются такому алгоритму в исходной шкале подсчета, в результате будут преобладать высокоэкспрессированные, сильно вариабельные гены; если используются данные, преобразованные в логарифм, чрезмерный вес будет придан слабо экспрессируемым генам, которые показывают преувеличенные LFC, как обсуждалось выше. Таким образом, мы используем подход сжатия DESeq2 для реализации регуляризованного логарифмического преобразования (rlog) , которое ведет себя аналогично преобразованию log2 для генов с большим количеством подсчетов, при этом сокращаются вместе значения для разных выборок для генов с низким количеством.Таким образом, он избегает обычно наблюдаемого свойства стандартного логарифмического преобразования, разделения данных для генов с малым числом счетчиков, где случайный шум, вероятно, будет доминировать над любым биологически значимым сигналом. Когда мы рассматриваем дисперсию каждого гена, вычисленную по выборкам, эти дисперсии стабилизируются — то есть примерно одинаковы или гомоскедастичны — после преобразования rlog, в то время как в противном случае они будут сильно зависеть от средних значений. Таким образом, это облегчает многомерную визуализацию и упорядочение, например кластеризацию или анализ главных компонентов, которые, как правило, работают лучше всего, когда переменные имеют одинаковый динамический диапазон.Обратите внимание, что хотя преобразование rlog основано на нашем подходе к сжатию LFC, оно отличается от описанной выше процедуры статистического вывода для анализа дифференциального выражения, в которой используются необработанные подсчеты, а не преобразованные данные, и не является ее частью.

Преобразование rlog вычисляется путем подбора для каждого гена GLM с базовой экспрессией (т. Е. Только с перехватом) и вычисления для каждого образца суженных LFC относительно базовой линии с использованием той же эмпирической процедуры Байеса, что и раньше (Материалы и методы).Однако здесь информация о ковариате образца (например, лечение или контроль) не используется, так что все образцы обрабатываются одинаково. Преобразование rlog учитывает вариацию глубины секвенирования по образцам, поскольку оно представляет собой логарифм q _ij с учетом размерных факторов s _ij . Это контрастирует с преобразованием стабилизации дисперсии (VST) для сверхдисперсных счетчиков, введенным в DESeq [4]: ​​хотя VST также эффективен для стабилизации дисперсии, он не учитывает напрямую различия в факторах размера; а в наборах данных с большим разбросом глубины секвенирования (динамический диапазон размерных факторов 4) мы наблюдали нежелательные артефакты в работе VST.Однако недостатком преобразования rlog по отношению к VST является то, что порядок генов в образце будет меняться, если соседние гены подвергаются сжатию разной силы. Как и в случае с VST, значение rlog ( K _ij ) для больших отсчетов примерно равно log2 ( K _ij / с _с ). И преобразование rlog, и VST предоставляются в пакете DESeq2 .

Мы демонстрируем использование преобразования rlog в наборе данных RNA-seq Hammer et al. [26], где РНК секвенировали из ганглия задних корешков крыс, перенесших перевязку спинномозгового нерва, и контрольных групп, через 2 недели и через 2 месяца после перевязки. Матрица подсчета для этого набора данных была загружена с онлайн-ресурса ReCount [27]. Этот набор данных предлагает более тонкие различия между условиями, чем Bottomly et al. [16] набор данных. На рисунке 5 представлены диагностические графики нормализованных подсчетов под обыкновенным логарифмом с псевдосчетом, равным 1, и преобразованием rlog, показывающие, что rlog как стабилизирует дисперсию в диапазоне среднего значения отсчетов, так и помогает находить значимые закономерности в данных.

Рисунок 5

Стабилизация дисперсии и кластеризация после преобразования rlog. Два преобразования были применены к счетам Hammer et al. [26] набор данных: логарифм нормализованных отсчетов плюс псевдосчет, т. Е. f ( K _ij ) = log2 ( K _ij / с _с +1) и rlog.Стандартное отклонение преобразованных значений по генам варьируется в диапазоне средних значений счетчиков с использованием логарифма (A) , в то время как относительно стабильно с использованием rlog (B) . Иерархическая кластеризация на евклидовых расстояниях и полная связь с использованием rlog (D) преобразованных данных группирует образцы в группы, определенные обработкой и временем, в то время как использование логарифмически преобразованных счетчиков (C) дает более неоднозначный результат. SD, стандартное отклонение.

Анализ на уровне генов

Здесь мы представляем DESeq2 для анализа подсчета на каждый ген, то есть общего количества считываний, которые могут быть однозначно присвоены гену. Напротив, несколько алгоритмов [28], [29] работают с вероятностным назначением считываний транскриптам, где множественные перекрывающиеся транскрипты могут происходить из каждого гена. Было отмечено, что подход с использованием общего подсчета чтения может привести к ложному обнаружению дифференциальной экспрессии, когда на самом деле изменяется только длина изоформ транскрипта, и даже к неправильному знаку LFC в крайних случаях [28].Однако в нашем тесте, который обсуждается в следующем разделе, мы обнаружили, что несоответствия в знаке LFC между общим счетчиком чтения и методами, основанными на вероятностном назначении, были редкими для генов, которые дифференциально экспрессировались в соответствии с любым методом (дополнительный файл 1: рисунок S5). Кроме того, если оценки средней длины транскрипта доступны для условий, они могут быть включены в структуру DESeq2 в качестве факторов нормализации, специфичных для гена и образца. Кроме того, подход, используемый в DESeq2 , может быть расширен до анализа, специфичного для изоформ, либо посредством обобщенного линейного моделирования на уровне экзона с использованием генно-специфического среднего значения, как в пакете DEXSeq [30], либо путем подсчета доказательств для альтернативных вариантов. изоформы в графах сращивания [31], [32].Фактически, последняя версия DEXSeq теперь использует DESeq2 в качестве механизма вывода и, таким образом, предлагает оценку уменьшения дисперсии и размеров эффекта для анализа на уровне экзонов.

Сравнительные тесты

Чтобы оценить, насколько хорошо DESeq2 выполняет стандартный анализ по сравнению с другими текущими методами, мы использовали комбинацию моделирования и реальных данных. Сравнивались подходы на основе отрицательного бинома: DESeq (старый) [4], edgeR [33], edgeR с надежным вариантом [34], DSS [6] и EBSeq [35] .Среди других сравниваемых методов были метод нормализации voom с последующим линейным моделированием с использованием пакета limma [36] и метод перестановки SAMseq пакета samr [24]. Для тестов с использованием реальных данных был включен метод Cuffdiff 2 [28] из набора Cufflinks. Номера версий используемого программного обеспечения см. В Дополнительном файле 1: Таблица S3. Для всех алгоритмов, возвращающих значения P , значения P из генов с ненулевой суммой счетчиков считываний по выборкам были скорректированы с использованием процедуры Бенджамини – Хохберга [21].

Тесты посредством моделирования

Чувствительность и точность Мы смоделировали наборы данных из 10 000 генов с отрицательным биномиальным распределенным счетом. Чтобы моделировать данные с реалистичными моментами, среднее значение и дисперсии были взяты из совместного распределения средних и оценок разброса по генам из Pickrell et al. Данные , соответствующие только члену перехвата. Эти наборы данных имели различный общий размер выборки ( m ∈ {6,8,10,20}), и выборки были разделены на две группы равного размера; 80% смоделированных генов не имели истинной дифференциальной экспрессии, в то время как для 20% генов истинные кратные изменения в 2, 3 и 4 использовались для генерации подсчетов в двух группах, причем направление кратного изменения выбиралось случайным образом.Смоделированные дифференциально экспрессируемые гены были выбраны равномерно случайным образом среди всех генов во всем диапазоне средних значений. MA-графики истинных кратных изменений, используемых в моделировании, и наблюдаемых кратных изменений, вызванных моделированием для одной из настроек моделирования, показаны в дополнительном файле 1: Рисунок S6.

Работа алгоритмов в тесте моделирования оценивалась по их чувствительности и точности. Чувствительность рассчитывали как долю генов с скорректированным значением P <0.1 среди генов с истинными различиями между средними значениями группы. Прецизионность рассчитывалась как доля генов с истинными различиями между средними значениями группы среди тех, у которых скорректированное значение P <0,1. Чувствительность нанесена на график с точностью до 1, или FDR, на рис. 6. DESeq2 , а также edgeR часто имели самую высокую чувствительность из алгоритмов, которые контролировали ошибку типа I в том смысле, что фактическая FDR была на уровне или ниже 0,1, пороговое значение для скорректированных значений P , используемых для вызова дифференциально экспрессируемых генов. DESeq2 имел более высокую чувствительность по сравнению с другими алгоритмами, особенно для небольшого кратного изменения (2 или 3), что также было обнаружено в тестах, выполненных Zhou et al. [34]. Для больших размеров выборки и больших кратных изменений производительность различных алгоритмов была более стабильной.

Рисунок 6

Чувствительность и точность алгоритмов в зависимости от комбинаций размера выборки и размера эффекта. DESeq2 и edgeR часто имели самую высокую чувствительность среди тех алгоритмов, которые управляли FDR, т.е.е., те алгоритмы, которые попадают на или слева от вертикальной черной линии. Для получения графика зависимости чувствительности от частоты ложных срабатываний, а не для FDR, см. Дополнительный файл 1: Рисунок S8, а для зависимости чувствительности от среднего значения счетчика см. Дополнительный файл 1: Рисунок S9. Обратите внимание, что EBSeq фильтрует гены с небольшим количеством (подробности см. В основном тексте).

Можно наблюдать чрезмерно консервативный вызов старого инструмента DESeq с меньшей чувствительностью по сравнению с другими алгоритмами и фактическим значением FDR ниже номинального значения 0.1. Отметим, что EBSeq версии 1.4.0 по умолчанию удаляет гены с низким счетом — чей 75% квантиль нормализованных значений меньше десяти — перед вызовом дифференциальной экспрессии. Чувствительность алгоритмов к смоделированным данным в диапазоне средних значений более подробно сравнивается в Дополнительном файле 1: Рисунок S9.

Чувствительность к выбросам Мы использовали моделирование, чтобы сравнить чувствительность и специфичность метода обработки выбросов DESeq2 и edgeR , который был недавно добавлен в программное обеспечение и опубликован, пока эта рукопись находилась на рассмотрении. edgeR теперь включает необязательный метод обработки выбросов путем итеративного переоборудования GLM после снижения веса потенциальных выбросов [34]. Моделирование, обобщенное в Дополнительном файле 1: Рисунок S10, показало, что оба подхода к выбросам почти восстанавливают производительность в наборе данных без выбросов, хотя edgeR-robust имел немного более высокий фактический, чем номинальный FDR, как показано в Дополнительном файле 1: Рисунок S11.

Точность оценок кратного изменения Мы протестировали подход DESeq2 с использованием эмпирического метода до достижения сокращения оценок LFC с двумя конкурирующими подходами: методом GFOLD , который может анализировать эксперименты без повторения [20], а также может также обрабатывать эксперименты с репликами и пакет edgeR , который обеспечивает сжатие на основе псевдосчета, называемое прогнозирующими LFC .Результаты сведены в Дополнительный файл 1: Рисунки S12 – S16. DESeq2 имел стабильно низкую среднеквадратичную ошибку и среднюю абсолютную ошибку во всем диапазоне размеров выборки и моделей для распределения истинных LFC. GFOLD имел такую ​​же низкую ошибку, как DESeq2 по всем генам; однако при рассмотрении дифференциально экспрессируемых генов он показал худшие результаты при больших размерах выборки. edgeR с настройками по умолчанию имел такую ​​же низкую ошибку, как DESeq2 , когда фокусировался только на дифференциально экспрессируемых генах, но имел более высокую ошибку по всем генам.

Кластеризация Мы сравнили производительность преобразования rlog с другими методами преобразования или вычисления расстояния при восстановлении смоделированных кластеров. Скорректированный индекс Рэнда [37] использовался для сравнения иерархической кластеризации, основанной на различных расстояниях, с истинным членством в кластере. Мы проверили евклидово расстояние для нормализованных подсчетов, логарифма нормализованных подсчетов плюс псевдосчет 1, отсчетов, преобразованных в rlog, и подсчетов VST. Кроме того, мы сравнили эти евклидовы расстояния с расстоянием Пуассона, реализованным в пакете PoiClaClu [38], и расстоянием, реализованным внутри в функции plotMDS edgeR (хотя и не расстоянием по умолчанию, которое аналогично логарифму). нормализованных отсчетов).Результаты, показанные в Дополнительном файле 1: Рисунок S17, показали, что, когда коэффициенты размера были равны для всех выборок, расстояние Пуассона и евклидово расстояние преобразованных с помощью rlog или VST счетчиков превзошли другие методы. Однако, когда коэффициенты размера не были равны для разных выборок, подход rlog обычно превосходил другие методы. Наконец, отметим, что преобразование rlog предоставляет нормализованные данные, которые могут использоваться для множества приложений, одним из которых является вычисление расстояния.

Бенчмарк для данных секвенирования РНК

Хотя моделирование полезно для проверки того, насколько хорошо алгоритм ведет себя с идеализированными теоретическими данными, и, следовательно, может подтвердить, что алгоритм работает так, как ожидалось, при собственных предположениях, моделирование не может сообщить нам, насколько хорошо теория соответствует действительности . С данными RNA-seq возникает сложность, заключающаяся в незнании полностью или непосредственно лежащей в основе истины; однако мы можем обойти это ограничение, используя более косвенный вывод, описанный ниже.

В следующих тестах мы рассмотрели три показателя производительности для вызова дифференциального выражения: частота ложных срабатываний (или 1 минус специфичность), чувствительность и точность. Мы можем получить значимые оценки специфичности, глядя на наборы данных, в которых, по нашему мнению, все гены подпадают под нулевую гипотезу об отсутствии дифференциальной экспрессии [39]. Чувствительность и точность оценить труднее, поскольку они требуют независимого знания тех генов, которые экспрессируются по-разному.Чтобы обойти эту проблему, мы использовали экспериментальную воспроизводимость на независимых выборках (хотя и из того же набора данных) в качестве прокси. Мы использовали набор данных с большим количеством реплик в обеих из двух групп, где мы ожидаем, что существуют действительно дифференциально экспрессируемые гены. Мы неоднократно разделяли этот набор данных на оценочный набор и более крупный проверочный набор и сравнивали вызовы из оценочного набора с вызовами из проверочного набора, которые были приняты за истину. Важно помнить, что вызовы из набора проверки являются только приближением истинного дифференциального состояния, а ошибка приближения имеет систематическую и стохастическую составляющие.Стохастическая ошибка становится небольшой, если размер выборки проверочного набора достаточно велик. Что касается систематических ошибок, наш тест предполагает, что они влияют на все алгоритмы более или менее одинаково и не меняют заметно ранжирование алгоритмов.

Частота ложных срабатываний Чтобы оценить частоту ложных срабатываний алгоритмов, мы рассмотрели фиктивные сравнения из набора данных с большим количеством выборок и без известного условия разделения выборок на отдельные группы. Мы использовали данные РНК-seq Pickrell et al. [17] для линий лимфобластоидных клеток, полученных от неродственных нигерийцев. Мы выбрали набор из 26 образцов последовательностей РНК одинаковой длины чтения (46 пар оснований) от мужчин. Мы случайным образом отобрали без замены десять образцов из набора для сравнения пяти с пятью, и этот процесс был повторен 30 раз. Мы оценили частоту ложных срабатываний, связанную с критическим значением 0,01, разделив количество значений P меньше 0,01 на общее количество тестов; гены с нулевой суммой счетчиков считываний по выборкам были исключены.Результаты 30 повторений, представленные на рисунке 7, показали, что все алгоритмы в целом контролировали количество ложных срабатываний. DESeq (старый) и Cuffdiff 2 оказались слишком консервативными в этом анализе, не израсходовав свой бюджет ошибок первого типа.

Рисунок 7

Контрольный показатель ложноположительных вызовов. Показаны оценки P (значение P <0,01) при нулевой гипотезе. FPR - это количество P значений меньше 0.01, деленное на общее количество тестов из случайно выбранных сравнений пяти и пяти образцов из теста Pickrell et al. [17], при отсутствии известных условий разделения выборок. Контроль ошибок типа I требует, чтобы инструмент не превышал номинальное значение 0,01 (черная линия). Результаты EBSeq не были включены в этот график, поскольку он возвращает апостериорные вероятности, которые, в отличие от значений P , не должны быть равномерно распределены при нулевой гипотезе.FPR, количество ложных срабатываний.

Чувствительность Чтобы получить представление о чувствительности алгоритмов, мы рассмотрели Bottomly et al. Набор данных [16], который содержит десять и одиннадцать повторов двух разных генетически однородных линий мышей. Это позволило разделить три против трех для оценочного набора и семь против восьми для проверочного набора, которые были сбалансированы по трем экспериментальным сериям. Случайные разбиения повторяли 30 раз. Информация о пакете не была предоставлена ​​для алгоритмов DESeq (старый) , DESeq2 , DSS , edgeR или voom , которые могут учитывать сложные экспериментальные проекты, чтобы иметь сопоставимые вызовы по всем алгоритмам.

Мы чередовали каждый алгоритм, чтобы определить вызовы проверочного набора. Для вызовов набора проверки данного алгоритма мы протестировали вызовы набора оценки каждого алгоритма. Мы использовали этот подход, а не метод, основанный на консенсусе, поскольку мы не хотели отдавать предпочтение или отрицать какой-либо конкретный алгоритм или группу алгоритмов. Чувствительность была рассчитана, как в тесте моделирования, теперь с истинным дифференциальным выражением, определяемым скорректированным значением P <0,1 в более крупном наборе для проверки, как показано в дополнительном файле 1: Рисунок S18.На рисунке 8 показаны оценки чувствительности для каждой пары алгоритмов.

Рисунок 8

Чувствительность оценивается по экспериментальной воспроизводимости. Чувствительность каждого алгоритма в наборе оценки (прямоугольные диаграммы) оценивается с использованием вызовов каждого другого алгоритма в наборе проверки (панели с серой меткой).

Ранжирование алгоритмов в целом было согласованным, независимо от того, какой алгоритм был выбран для определения вызовов в проверочном наборе. DESeq2 имел сопоставимую чувствительность с edgeR и voom , но меньше, чем DSS .Средняя оценка чувствительности обычно составляла от 0,2 до 0,4 для всех алгоритмов. То, что все алгоритмы имели относительно низкую медианную чувствительность, можно объяснить небольшим размером выборки оценочного набора и тем фактом, что увеличение размера выборки в проверочном наборе увеличивает мощность. Ожидалось, что основанный на перестановках метод SAMseq редко будет давать скорректированное значение P <0,1 в оценочном наборе, потому что сравнение трех против трех не обеспечивает достаточного количества перестановок.

Precision Еще одним важным фактором, который следует учитывать с точки зрения исследователя, является точность или доля истинно положительных результатов в наборе генов, которые проходят скорректированный порог значения P . Об этом также можно сообщить как 1-FDR. Опять же, «истинное» дифференциальное выражение было определено скорректированным значением P <0,1 в более крупном наборе для проверки. Оценки точности показаны на рисунке 9, где мы можем видеть, что DESeq2 часто имеет второе место по средней точности после DESeq (старый) .Мы также можем видеть, что алгоритмы с более высокой средней чувствительностью, например, DSS , обычно были связаны здесь с более низкой средней точностью. Рейтинги значительно различались, когда Cuffdiff 2 использовалось для определения вызовов проверочного набора. Вероятно, это связано с дополнительными этапами Cuffdiff 2 , выполненными для деконволюции изменений численности на уровне изоформ от численности на уровне гена, что, по-видимому, произошло за счет более низкой точности по сравнению с вызовами его собственного проверочного набора.

Рисунок 9

Прецизионность оценивается по экспериментальной воспроизводимости. Точность каждого алгоритма в наборе оценки (прямоугольные диаграммы) оценивается с использованием вызовов каждого другого алгоритма в наборе проверки (панели с серой меткой).

Для дальнейшего сравнения результатов чувствительности и точности мы рассчитали точность алгоритмов по сетке номинальных скорректированных значений P (дополнительный файл 1: Рисунок S19). Затем мы нашли номинальное скорректированное значение P для каждого алгоритма, в результате чего средняя фактическая точность составила 0.9 (FDR = 0,1). Таким образом, откалибровав каждый алгоритм для целевого FDR, мы оценили чувствительность вызова, как показано в Дополнительном файле 1: Рисунок S20. Как и ожидалось, здесь алгоритмы более похожи друг на друга. Этот анализ показал, что для заданной целевой точности DESeq2 часто входил в число лучших алгоритмов по средней чувствительности, хотя вариативность между случайными повторами была больше, чем различия между алгоритмами.

Абсолютное количество вызовов для наборов оценки и проверки можно увидеть в Дополнительном файле 1: Рисунки S21 и S22, которые в основном соответствуют порядку, указанному на графике чувствительности на Рисунке 8.Дополнительный файл 1. На рисунках S23 и S24 представлены тепловые карты и кластеризация на основе индекса вызовов Жаккара для одной копии наборов оценки и проверки, что указывает на большое перекрытие вызовов по различным алгоритмам.

Таким образом, сравнительные тесты показали, что DESeq2 эффективно контролировал ошибки типа I, поддерживая средний уровень ложных срабатываний чуть ниже выбранного критического значения при имитационном сравнении групп образцов, случайно выбранных из большего пула.Как для моделирования, так и для анализа реальных данных, DESeq2 часто достигал наивысшей чувствительности из тех алгоритмов, которые управляли FDR.

All-In-One Appeal Package — Z-Fold Card Style Package

Описание продукта

Мы сделали этот процесс действительно простым и экономичным! Наши почтовые рассылки в стиле Z-Fold с конвертами для денежных переводов УНИКАЛЬНЫ, и они упорно трудятся, чтобы принести доллары для пожертвований!

Апелляционное письмо для продажи товаров по почте с отрывной формой перевода.Ищете что-то НОВОЕ в этом году? Попробуйте этот Z-Fold Card Style All In One Appeal Package. Это уникально и поистине вдохновляет. Ваши дарители будут приглашены открыть этот конверт в виде приглашения и ответить на ваш запрос о поддержке и пожертвованиях. Свяжитесь с нами сегодня, чтобы заказать или узнать больше!

В этот комплект входят три отдельных предмета:
1) Размер A7, привлекательность в стиле Z-образной карточки (80 фунтов Classic, гладкая белая обложка)
2) Подходящий внешний конверт A7 (классический, гладкая белая бумага)
3) A 24 Lb White Wove, No.Конверт с денежным переводом 6 3/4 (для того, чтобы ваш жертвователь заполнил и отправил вам по почте с чеком!)

Напечатано, сложено, вставлено и отправлено по почте. Этот пакет идеально подходит для небольших целенаправленных кампаний по прямой почтовой рассылке (50–1000). Цена включает полноцветную печать Z-Fold Card (одностороннюю) с изменяемыми сообщениями, полноцветную печать и печать с переменным адресом внешнего конверта A7, полноцветную печать 6-дюймового конверта для перевода денег, сортировку списка рассылки (NCOA / Presort), вставку и отправку почты . Заказчик оплачивает почтовые расходы. Клиент предоставляет нам номер разрешения или может использовать наш номер.

Отзывы клиентов

5 звезд 0 0%

4 звезды 0 0%

3 звезды 0 0%

2 звезды 0 0%

1 звезда 0 0%

Только зарегистрированные клиенты, которые приобрели этот продукт, могут оставить отзыв.

Функция сворачивания

— RDocumentation

greedy , n_dist , n_fill , n_last , n_rand , l_sizes , l_starts , лестница , или простые числа .

Уведомление : примеры размеров сгенерированных групп на основе вектора с 57 элементами.

жадный

Жадно разделяет данные на заданный размер группы \ ((например, 10, 10, 10, 10, 10, 7) \).

n — размер группы

n_dist (по умолчанию)

Делит данные на указанное количество групп и распределяет лишние точки данных по группам \ ((например, 11, 11, 12, 11, 12) \).

n — количество групп

n_fill

Делит данные на указанное количество групп и с самого начала заполняет группы лишними точками данных \ ((например, 12, 12, 11, 11, 11) \).

n — количество групп

n_last

Разделяет данные на указанное количество групп.Он находит максимально равные размеры групп, используя все точки данных. Только последняя группа может отличаться по размеру. \ ((например, 11, 11, 11, 11, 13) \).

n — количество групп

n_rand

Разделяет данные на указанное количество групп. Лишние точки данных размещаются в группах случайным образом (только по 1 на группу). \ ((например, 12, 11, 11, 11, 12) \).

n — количество групп

l_размеры

Разделяет данные по списку размеров групп. Лишние точки данных помещаются в дополнительную группу в конце.\ ((например, n = list (0.2,0.3) выводит группы с размерами (11,17,29)) \).

n — список размеров группы

l_starts

Запускает новые группы с указанными значениями вектора.

n — список начальных позиций. Пропускать значения по c (значение, skip_to_number), где skip_to_number — это n-е появление значения в векторе. Группы автоматически начинаются с первой точки данных.

\ (Например, n = c (1,3,7,25,50) выводит группы с размерами (2,4,18,25,8) \).

Чтобы пропустить: \ (данный вектор c («a», «e», «o», «a», «e», «o»), n = list («a», «e», c ( «о», 2)) выводит группы размером (1,4,1) \).

Если передать \ (n = ‘auto’ \), начальные позиции будут автоматически найдены с помощью find_starts () .

подъезд

Использует размер шага для разделения данных. Размер группы увеличивается на 1 шаг для каждой группы, пока не будет больше данных \ ((например, 5, 10, 15, 20, 7) \).

n — размер шага

простых чисел

В качестве размера группы использует простые числа. Размер группы увеличивается до следующего простого числа пока не будет больше данных. \ ((например, 5, 7, 11, 13, 17, 4) \).

n — это простое число, чтобы начать с

Пакет матов для отдыха Fold-n-Lock — играйте с целями

Пакет матов для отдыха Fold-n-Lock — играйте с целями использовать! Классным комнатам и центрам по уходу за детьми понравится возможность использовать съемные полки, обеспечивающие легкий доступ, и петли без защемления для размещения двадцати четырех 1-дюймовых складных матов или двенадцати 2-дюймовых складных матов.

Складной деревянный шкаф обеспечивает легкий доступ; Прочная и классическая конструкция из балтийской березы с колесиками easy-roll дает взрослым возможность переставлять и катиться! Поставляется полностью собранным и готовым к эксплуатации.Выберите упаковку из 24 ковриков (толщиной 1 фут) или упаковку из 12 ковриков (толщиной 2 фута) с местом для хранения или выберите только шкаф для хранения. Открывается до 58 футов x 18 футов x 48 футов; 192 фунта Доставка грузовиком.

Вы покрываетесь, когда делаете покупки в игре с определенной целью

• Безусловная 100% гарантия соответствия
  
• Инновационные продукты
• Superior Selection
  & Service

Обзоры

Мы используем файлы cookie, чтобы вам было удобнее работать с сайтом .
Используя веб-сайт PWAP, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Принять

{«»: {«id»: 17633, «price»: «1719,00 долларов США», «retailPrice»: «1719,00 долларов США», «salePrice»: «Недоступно», «stockStatus»: «Прямая доставка», «upc» «:» 44-502 «,» uom «:» Pack «,» externalId «:» 23766 «,» shipDisplayDate «:» 10-04-2021 «,» mediaUrl «:» / cmsstatic / img / 851 / p- 88203-fold-lock-rest-mat-pack-clean.jpg «,» mediaAlt «:» 1 \ «Пакет толстых подкладок (24 коврика)», «mediaTitle»: «», «mediaTags»: «», » name «:» 1 \ «толстый упорный мат (24 коврика)», «colorGradient»: null, «dateFormat»: «MM-dd-yyyy»}, «- 1»: {«id»: 17634, «price «:» 1459 долларов.00 »,« retailPrice »:« $ 1,459.00 »,« salePrice »:« Недоступно »,« stockStatus »:« Прямая доставка »,« upc »:« 44-503 »,« uom »:« Pack »,« externalId » : «23767», «shipDisplayDate»: «10-04-2021», «mediaUrl»: «/ cmsstatic / img / 851 / p-88203-fold-lock-rest-mat-pack-clean.jpg», «mediaAlt» «:» 2 \ «Пакет толстых матов для отдыха (12 матов)», «mediaTitle»: «Шкаф для хранения деревянных ковриков с запирающимися дверцами», «mediaTags»: «», «name»: «2 \» Пакет толстых матов для отдыха ( 12 матов) «,» colorGradient «: null,» dateFormat «:» MM-dd-yyyy «}}

Напишите и отредактируйте исходный код

Когда вы работаете с кодом, IntelliJ IDEA гарантирует, что ваша работа не будет стрессовой.Он предлагает различные сочетания клавиш и функции, которые помогут вам добавлять, выбирать, копировать, перемещать, редактировать, сворачивать, находить вхождения и сохранять код.

Для навигации внутри редактора см. Основы работы с редактором.

Действие поиска

Вы можете использовать тот же диалог для поиска классов, файлов или символов. Для получения дополнительной информации обратитесь к Поиску везде.

Добавить новый класс, файл, пакет или рабочий файл

• В редакторе нажмите Ctrl + Alt + Insert , чтобы добавить класс, файл или пакет.

  Если фокус находится внутри окна инструмента «Проект» и вы хотите добавить новый элемент, нажмите Alt + Insert .

• Чтобы создать новый файл Scratch, нажмите Ctrl + Alt + Shift + Insert .

  IntelliJ IDEA создает временный файл, который можно запускать и отлаживать. Для получения дополнительной информации см. Scratch-файлы.

Переключить атрибут файла только для чтения

Если файл доступен только для чтения, он помечается значком закрытого замка в строке состояния, на вкладке редактора или в окне инструмента «Проект».Если файл доступен для записи, он помечается значком открытого замка в строке состояния.

1. Откройте файл в редакторе или выберите его в окне инструмента «Проект».

2. Выполните одно из следующих действий:

   • В главном меню выберите или.

   • Щелкните значок замка в строке состояния.

Если статус только для чтения установлен системой контроля версий, рекомендуется использовать функции интеграции контроля версий IntelliJ IDEA.Для получения дополнительной информации см. Контроль версий.

Выбрать конструкции кода

• В редакторе поместите курсор на элемент, который вы хотите выделить, и нажмите Ctrl + W / Ctrl + Shift + W , чтобы расширить или уменьшить выделение.

  Например, в текстовом файле выделение начинается со всего слова, затем продолжается до предложения, абзаца и т. Д.

  В файле Java, если вы начнете с выбора аргумента в вызове метода, он будет распространяться на все аргументы, затем на весь метод, затем на выражение, содержащее этот метод, затем на более крупный блок выражений и т. Д. на.

• Если вам нужно просто выделить фигурные скобки, поместите каретку сразу после закрывающей скобки / скобки блока или перед открывающей скобкой / скобкой блока.

Выберите код в соответствии с заглавными буквами

1. В диалоговом окне «Настройки / Предпочтения» Ctrl + Alt + S перейдите к.

2. Установите флажок Использовать слова «CamelHumps».

Если вы хотите использовать двойной щелчок при выборе в соответствии с заглавными буквами, убедитесь, что слова Honor CamelHumps… установлен флажок в редакторе | Общая страница диалога настроек / предпочтений Ctrl + Alt + S .

Настроить вкладки и отступы

1. В диалоговом окне «Настройки / Предпочтения» Ctrl + Alt + S перейдите к.

2. Выберите язык, для которого вы хотите настроить отступ.

3. Из параметров справа, на вкладках и отступах, выберите использовать символ табуляции, чтобы редактор использовал табуляции при нажатии Tab , отступа или переформатирования кода.При необходимости вы также можете настроить размер вкладки. Если вы не выберете этот параметр, IntelliJ IDEA будет использовать пробелы.

Скопируйте и вставьте код

Вы можете использовать стандартные горячие клавиши, чтобы скопировать Ctrl + C и вставить Ctrl + V любой выделенный фрагмент кода. Если ничего не выбрано, IntelliJ IDEA автоматически копирует всю строку, в которой находится курсор.

По умолчанию, когда вы вставляете что-либо в редактор, IntelliJ IDEA выполняет «умную» вставку, например, вставка нескольких строк в комментарии автоматически добавит соответствующие маркеры к строкам, которые вы вставляете.Если вам нужно вставить простой текст, нажмите Ctrl + Alt + Shift + V .

• Поместите курсор в строку или символ, щелкните правой кнопкой мыши, чтобы открыть контекстное меню, выберите. Когда вы выбираете опцию Копировать ссылку ( Ctrl + Alt + Shift + C ), IntelliJ IDEA создает ссылочную строку, которая включает номер строки выбранной строки или символа. Вы можете нажать Ctrl + V , чтобы вставить скопированную ссылку в любом месте.

• IntelliJ IDEA отслеживает все, что вы копируете в буфер обмена.Чтобы вставить из истории, в редакторе в контекстном меню выберите ( Ctrl + Shift + V ). В открывшемся диалоговом окне выберите свою запись и нажмите «Вставить».

  По умолчанию количество элементов, хранящихся в истории буфера обмена, равно 100.

• Когда вы копируете и вставляете код в редактор, IntelliJ IDEA отображает скрытые (специальные) символы, представленные их сокращением имени Unicode.

Строки кода

IntelliJ IDEA предлагает несколько полезных сокращений для управления строками кода.

Если вам нужно отменить или повторить изменения, нажмите Ctrl + Z / Ctrl + Shift + Z соответственно.

• Чтобы добавить строку после текущей, нажмите Shift + Enter . IntelliJ IDEA перемещает курсор на следующую строку.

• Чтобы добавить строку перед текущей, нажмите Ctrl + Alt + Enter . IntelliJ IDEA перемещает курсор на предыдущую строку.

• Чтобы продублировать линию, нажмите Ctrl + D .

• Чтобы отсортировать строки в алфавитном порядке во всем файле или при выборе кода, в главном меню выберите или.Эти действия могут быть полезны при работе с файлами свойств, наборами данных, текстовыми файлами, файлами журналов и т. Д. Если вам нужно назначить сочетания клавиш для этих действий, обратитесь к разделу Настройка сочетаний клавиш для получения дополнительной информации.

• Чтобы удалить строку, поместите курсор в нужную строку и нажмите Ctrl + Y .

  Обратите внимание, что при первой установке IntelliJ IDEA с раскладкой по умолчанию Windows появляется диалоговое окно, предлагающее сопоставить этот ярлык с действием «Повторить» или «Удалить строку».

  Чтобы настроить раскладку клавиатуры после установки, обратитесь к разделу Выбор правильной раскладки клавиатуры.

• Чтобы соединить линии, поместите курсор в линию, к которой вы хотите присоединить другие линии, и нажмите Ctrl + Shift + J . Нажимайте на клавиши, пока не соединятся все необходимые элементы.

  Вы также можете объединить строковые литералы, объявление поля или переменной и оператор. Обратите внимание, что IntelliJ IDEA проверяет настройки стиля кода и удаляет ненужные пробелы и избыточные символы.

• Чтобы разделить строковые литералы на две части, нажмите Введите .

  IntelliJ IDEA разбивает строку и предоставляет правильный синтаксис. Вы также можете использовать строку Break при намерении ‘\ n’ для разделения строковых литералов. Нажмите Alt + Enter или щелкните, чтобы выбрать это намерение.

• Чтобы прокомментировать строку кода, поместите курсор в соответствующую строку и нажмите Ctrl + / . Снова нажмите Ctrl + / в той же строке, чтобы раскомментировать ее.

• Чтобы переместить строку вверх или вниз, нажмите Alt + Shift + Up или Alt + Shift + Down соответственно.

• Чтобы переместить (поменять местами) элемент кода влево или вправо, поместите на него курсор или выберите его и нажмите Ctrl + Alt + Shift + Left для влево или Ctrl + Alt + Shift + Правый справа.

  Например, для Java вы можете использовать эти действия для вызова метода или аргументов объявления метода, констант перечисления, выражений инициализатора массива.Для XML или HTML используйте эти действия для атрибутов тегов.

Операторы кода

Операторы перемещения

• В редакторе поместите курсор в нужное место и нажмите Ctrl + Shift + Up , чтобы переместить инструкцию вверх, или Ctrl + Shift + Down , чтобы переместить заявление вниз. IntelliJ IDEA перемещает выбранный оператор, выполняя проверку синтаксиса.

Если перемещение оператора не разрешено в текущем контексте, действия будут отключены.

Полная текущая выписка

• В редакторе нажмите Ctrl + Shift + Enter или выберите в главном меню. IntelliJ IDEA автоматически вставляет требуемую конечную запятую в структуры, фрагменты и другие составные литералы. Каретка перемещается в позицию, где вы можете начать вводить следующий оператор.

Оператор развертывания или удаления

1. Поместите курсор в выражение, которое вы хотите удалить или развернуть.

2. Нажмите Ctrl + Shift + Delete .

   IntelliJ IDEA показывает всплывающее окно со всеми действиями, доступными в текущем контексте. Чтобы упростить различие между извлекаемыми операторами и операторами, которые необходимо удалить, IntelliJ IDEA использует разные цвета фона.

3. Выберите действие и нажмите Введите .

Фрагменты кода

• Перемещайте и копируйте фрагменты кода, перетаскивая их в редакторе.

  • Чтобы переместить фрагмент кода, выберите его и перетащите выделение в целевое место.

  • Чтобы скопировать выделение кода, удерживая нажатой кнопку Ctrl , перетащите его в нужное место.

    Действие копирования может быть недоступно в macOS, так как оно может конфликтовать с глобальными ярлыками ОС.

  По умолчанию функция перетаскивания включена. Чтобы отключить его, в диалоговом окне «Настройки / Предпочтения» Ctrl + Alt + S перейдите и снимите флажок «Включить функцию перетаскивания в редакторе» в разделе «Мышь».

• Для переключения между верхним и нижним регистром для выбранного фрагмента кода нажмите Ctrl + Shift + U .

  Обратите внимание, что когда вы применяете действие переключения регистра к формату имени CamelCase , IntelliJ IDEA преобразует имя в нижний регистр.

Свертывание кода

Свернутые фрагменты кода показаны в виде закрашенных эллипсов (). Если свернутый фрагмент кода содержит ошибки, IntelliJ IDEA выделяет фрагмент красным цветом.

Чтобы настроить поведение сворачивания кода по умолчанию, в диалоговом окне «Настройки / Предпочтения» Ctrl + Alt + S перейдите к.

Если IntelliJ IDEA изменит код в свернутом фрагменте во время переформатирования кода, фрагмент кода будет автоматически развернут.

Развернуть или свернуть элементы кода

• Чтобы свернуть или развернуть фрагмент кода, нажмите Ctrl + NumPad - / Ctrl + NumPad + . IntelliJ IDEA сворачивает или разворачивает текущий фрагмент кода, например, одним методом.

• Чтобы свернуть или развернуть все фрагменты кода, нажмите Ctrl + Shift + NumPad - / Ctrl + Shift + NumPad + .

  IntelliJ IDEA сворачивает или разворачивает все фрагменты в выделенном фрагменте или, если ничего не выбрано, все фрагменты в текущем файле, например, все методы в файле.

• Чтобы рекурсивно свернуть или развернуть код, нажмите Ctrl + Alt + NumPad - / Ctrl + Alt + NumPad + . IntelliJ IDEA сворачивает или разворачивает текущий фрагмент и все его подчиненные области внутри этого фрагмента.

• Чтобы свернуть блоки кода, нажмите Ctrl + Shift +. . Это действие сворачивает фрагмент кода между совпадающей парой фигурных скобок {} , создает настраиваемую область сворачивания для этого фрагмента и делает его «складываемым».

• Чтобы свернуть или развернуть комментарии к документу в текущем файле, в главном меню выберите.

• Чтобы свернуть или развернуть фрагмент пользовательского кода, выберите его и нажмите Ctrl +. .

  Вы можете свернуть или развернуть любые вручную выбранные области в коде.

Свернуть или развернуть вложенные фрагменты

• Чтобы развернуть текущий фрагмент и все вложенные фрагменты, нажмите Ctrl + NumPad *, 1 . Вы можете расширить текущий фрагмент до указанного уровня вложенности (от 1 до 5).

• Чтобы развернуть все свернутые фрагменты в файле, нажмите Ctrl + Shift + NumPad *, 1 . Вы можете развернуть свернутые фрагменты до указанного уровня вложенности (от 1 до 5).

Использование действия «Окружить с»

С помощью действия можно свернуть или развернуть код.

1. В редакторе выделите фрагмент кода и нажмите Ctrl + Alt + T .

2. Во всплывающем меню выберите Комментарии или регион … endregion Комментарии.

3. При желании укажите описание, под которым будет скрыт свернутый фрагмент.

4. Чтобы свернуть или развернуть созданную область, нажмите Ctrl +. .

5. Чтобы перейти к созданной настраиваемой области, нажмите Ctrl + Alt +. .

Отключить контур сворачивания кода

Вы можете отключить контур сворачивания кода, который появляется на желобе.

1. В диалоговом окне «Настройки / Предпочтения» Ctrl + Alt + S перейдите к.

2. Снимите флажок.

Последнее изменение: 18 июля 2021 г.

Высокократное улучшение гидролиза различных упаковок из полиэтилентерефталата (ПЭТ) после потребления с использованием кутиназы Humicola insolens в качестве единственного биокатализатора

Основные характеристики

•

Enzymatic гидролиз поли (этилентерефталата) требует повышения выхода.

•

Кутиназа Humicola insolens является одним из наиболее эффективных ферментов деполимеризации.

•

Последовательный подход включал факторные планы и путь наискорейшего восхождения.

•

Концентрация терефталевой кислоты и производительность увеличены в 20 раз.

Реферат

Распространение технологий переработки полиэтилентерефталата (ПЭТ) имеет первостепенное значение в контексте экономики замкнутого цикла пластмасс. Одной из наиболее многообещающих альтернатив является использование ферментов в качестве катализаторов деполимеризации ПЭТ на его мономеры, но этот способ все еще нуждается в улучшении, особенно в отношении титра и производительности.В настоящей работе последовательный подход, состоящий из дробных факторных и центральных композиционных вращающихся конструкций, пути наискорейшего подъема и односторонней оценки переменного эффекта, был выполнен для устранения этих ограничений во время сортировки постпотребительского ПЭТ (ПК-ПЭТ). гидролиз, катализируемый кутиназой Humicola insolens . Наивысшая концентрация и производительность терефталевой кислоты во время гидролиза PC-PET составляли 100,9 мМ (16,8 г / л) и 14,4 мМ / день, что соответствует общему улучшению в 10 и 20 раз, соответственно.Эти данные являются одними из лучших результатов, описанных до сих пор для катализируемого ферментами гидролиза использованных ПЭТ-упаковок. Кроме того, использование одной ферментной системы вместо нескольких биокатализаторов для достижения окончательного превращения ПЭТ в его мономеры снижает сложность процесса и снижает затраты.

Ключевые слова

Кутиназа

Деполимеризация

Терефталевая кислота

Переработка ПЭТ

Humicola insolens

Рекомендуемые статьи Цитирующие статьи (0)

Полный текст

© 2019 Elsevier Ltd.